COL28A1
COL28A1 (англ. Collagen type XXVIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 125 амінокислот, а молекулярна маса — 116 657[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
| MWNRYFVFYL | LLLSAFTSQT | VSGQRKKGPK | SNLLARKSDV | QGSICFIDIV | ||||
| FIVDSSESSK | IALFDKQKDF | VDSLSDKIFQ | LTPGRSLEYD | IKLAALQFSS | ||||
| SVQIDPPFSS | WKDLQTFKQK | VKSMNLIGQG | TFSYYAISNA | TRLLKREGRK | ||||
| DGVKVVLLMT | DGIDHPKNPD | VQSISEDARI | SGISFITIAL | STVVNEAKLR | ||||
| LISGDSSSEP | TLLLSDPTLV | DKIQDRLDIL | FEKKCERKIC | ECEKGDPGDP | ||||
| GPPGTHGNPG | IKGERGPKGN | PGNAQKGEAG | ERGPGGIPGY | KGDKGERGEC | ||||
| GKPGIKGDKG | SPGPYGPKGP | RGIQGITGPP | GDPGPKGFQG | NKGEPGPPGP | ||||
| YGSPGAPGIG | QQGIKGERGQ | EGRPGAPGPI | GVGEPGQPGP | RGPEGVPGER | ||||
| GLPGEGFPGP | KGEKGSEGPT | GPQGLQGLSI | KGEKGDIGPV | GPQGPMGIPG | ||||
| IGSQGEQGIQ | GPIGPPGPQG | PAGQGLPGSK | GEVGQMGPTG | PRGPVGIGVQ | ||||
| GPKGEPGSIG | LPGQPGVPGE | DGAAGKKGEA | GLPGARGPEG | PPGKGQPGPK | ||||
| GDEGKKGSKG | NQGQRGLPGP | EGPKGEPGIM | GPFGMPGTSI | PGPPGPKGDR | ||||
| GGPGIPGFKG | EPGLSIRGPK | GVQGPRGPVG | APGLKGDGYP | GVPGPRGLPG | ||||
| PPGPMGLRGV | GDTGAKGEPG | VRGPPGPSGP | RGVGTQGPKG | DTGQKGLPGP | ||||
| PGPPGYGSQG | IKGEQGPQGF | PGPKGTMGHG | LPGQKGEHGE | RGDVGKKGDK | ||||
| GEIGEPGSPG | KQGLQGPKGD | LGLTKEEIIK | LITEICGCGP | KCKETPLELV | ||||
| FVIDSSESVG | PENFQIIKNF | VKTMADRVAL | DLATARIGII | NYSHKVEKVA | ||||
| NLKQFSSKDD | FKLAVDNMQY | LGEGTYTATA | LQAANDMFED | ARPGVKKVAL | ||||
| VITDGQTDSR | DKEKLTEVVK | NASDTNVEIF | VIGVVKKNDP | NFEIFHKEMN | ||||
| LIATDPEHVY | QFDDFFTLQD | TLKQKLFQKI | CEDFDSYLVQ | IFGSSSPQPG | ||||
| FGMSGEELSE | STPEPQKEIS | ESLSVTRDQD | EDDKAPEPTW | ADDLPATTSS | ||||
| EATTTPRPLL | STPVDGAEDP | RCLEALKPGN | CGEYVVRWYY | DKQVNSCARF | ||||
| WFSGCNGSGN | RFNSEKECQE | TCIQG |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL28A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL28A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22442 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
- ↑ UniProt, Q2UY09 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.