COL26A1

COL26A1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL26A1, EMI6, EMID2, EMU2, SH2B, collagen type XXVI alpha 1, collagen type XXVI alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 608927 MGI: 2155345 HomoloGene: 136636 GeneCards: COL26A1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
136227
140709
Ensembl
ENSG00000160963
ENSMUSG00000004415
UniProt
Q96A83
Q91VF6
RefSeq (мРНК)
NM_133457
NM_001278563
NM_024474
NM_001346699
RefSeq (білок)
NP_001265492
NP_597714
NP_001333628
NP_077794
Локус (UCSC) Хр. 7: 101.36 – 101.56 Mb Хр. 5: 136.77 – 136.91 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL26A1 (англ. Collagen type XXVI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 45 381[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKLALLLPWA CCCLCGSALA TGFLYPFSAA ALQQHGYPEP GAGSPGSGYA
SRRHWCHHTV TRTVSCQVQN GSETVVQRVY QSCRWPGPCA NLVSYRTLIR
PTYRVSYRTV TVLEWRCCPG FTGSNCDEEC MNCTRLSDMS ERLTTLEAKV
LLLEAAERPS SPDNDLPAPE STPPTWNEDF LPDAIPLAHP VPRQRRPTGP
AGPPGQTGPP GPAGPPGSKG DRGQTGEKGP AGPPGLLGPP GPRGLPGEMG
RPGPPGPPGP AGNPGPSPNS PQGALYSLQP PTDKDNGDSR LASAIVDTVL
AGVPGPRGPP GPPGPPGPRG PPGPPGTPGS QGLAGERGTV GPSGEPGVKG
EEGEKAATAE GEGVQQLREA LKILAERVLI LEHMIGIHDP LASPEGGSGQ
DAALRANLKM KRGGAQPDGV LAALLGPDPG QKSVDQASSR K

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Leimeister C., Steidl C., Schumacher N., Erhard S., Gessler M. (2002). Developmental expression and biochemical characterization of Emu family members. Dev. Biol. 249: 204—218. PMID 12221002 doi:10.1006/dbio.2002.0764
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18038 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, Q96A83 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також