BEST2

BEST2
Ідентифікатори
Символи	BEST2, VMD2L1, bestrophin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607335 MGI: 2387588 HomoloGene: 41187 GeneCards: BEST2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• chloride channel activity; • молекулярна функція;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • війка; • мембрана; • chloride channel complex;
Біологічний процес	• sensory perception of smell; • membrane depolarization; • chloride transport; • ion transport; • chloride transmembrane transport; • GO:0022610 життєдіяльність;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	54831
	212989
	ENSG00000039987
	ENSMUSG00000052819
	Q8NFU1
	Q8BGM5
	NM_017682
	NM_001130194
	NP_060152
	NP_001123666
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BEST2 (англ. Bestrophin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 57 139^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVTYTARVA	NARFGGFSQL	LLLWRGSIYK	LLWRELLCFL	GFYMALSAAY
RFVLTEGQKR	YFEKLVIYCD	QYASLIPVSF	VLGFYVTLVV	NRWWSQYLCM
PLPDALMCVV	AGTVHGRDDR	GRLYRRTLMR	YAGLSAVLIL	RSVSTAVFKR
FPTIDHVVEA	GFMTREERKK	FENLNSSYNK	YWVPCVWFSN	LAAQARREGR
IRDNSALKLL	LEELNVFRGK	CGMLFHYDWI	SVPLVYTQVV	TIALYSYFLA
CLIGRQFLDP	AQGYKDHDLD	LCVPIFTLLQ	FFFYAGWLKV	AEQLINPFGE
DDDDFETNFL	IDRNFQVSML	AVDEMYDDLA	VLEKDLYWDA	AEARAPYTAA
TVFQLRQPSF	QGSTFDITLA	KEDMQFQRLD	GLDGPMGEAP	GDFLQRLLPA
GAGMVAGGPL	GRRLSFLLRK	NSCVSEASTG	ASCSCAVVPE	GAAPECSCGD
PLLDPGLPEP	EAPPPAGPEP	LTLIPGPVEP	FSIVTMPGPR	GPAPPWLPSP
IGEEEENLA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Stoehr H., Marquardt A., Nanda I., Schmid M., Weber B.H.F. (2002). Three novel human VMD2-like genes are members of the evolutionary highly conserved RFP-TM family. Eur. J. Hum. Genet. 10: 281—284. PMID 12032738 doi:10.1038/sj.ejhg.5200796
Sun H., Tsunenari T., Yau K.-W., Nathans J. (2002). The vitelliform macular dystrophy protein defines a new family of chloride channels. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 4008—4013. PMID 11904445 doi:10.1073/pnas.052692999
Qu Z., Hartzell H.C. (2008). Bestrophin Cl- channels are highly permeable to HCO3-. Am. J. Physiol. 294: C1371—C1377. PMID 18400985 doi:10.1152/ajpcell.00398.2007

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17107 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8NFU1 (англ.) . Архів оригіналу за 21 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17107 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8NFU1 (англ.) . Архів оригіналу за 21 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]