RYR3

RYR3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи RYR3, RYR-3, ryanodine receptor 3
Зовнішні ІД OMIM: 180903 MGI: 99684 HomoloGene: 68151 GeneCards: RYR3
Пов'язані генетичні захворювання
атеросклероз, ВІЛ-заворювання[1]
Реагує на сполуку
аденозинтрифосфат, кофеїн, дантролен[2]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6263
20192
Ensembl
ENSG00000198838
ENSMUSG00000057378
UniProt
Q15413
A2AGL3
RefSeq (мРНК)
NM_001036
NM_001243996
NM_177652
NM_001319156
RefSeq (білок)
NP_001027
NP_001230925
NP_001306085
Локус (UCSC) Хр. 15: 33.31 – 33.87 Mb Хр. 2: 112.46 – 113.05 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RYR3 (англ. Ryanodine receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 870 амінокислот, а молекулярна маса — 552 042[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAEGGEGGED EIQFLRTEDE VVLQCIATIH KEQRKFCLAA EGLGNRLCFL
EPTSEAKYIP PDLCVCNFVL EQSLSVRALQ EMLANTGENG GEGAAQGGGH
RTLLYGHAVL LRHSFSGMYL TCLTTSRSQT DKLAFDVGLR EHATGEACWW
TIHPASKQRS EGEKVRIGDD LILVSVSSER YLHLSVSNGN IQVDASFMQT
LWNVHPTCSG SSIEEGYLLG GHVVRLFHGH DECLTIPSTD QNDSQHRRIF
YEAGGAGTRA RSLWRVEPLR ISWSGSNIRW GQAFRLRHLT TGHYLALTED
QGLILQDRAK SDTKSTAFSF RASKELKEKL DSSHKRDIEG MGVPEIKYGD
SVCFVQHIAS GLWVTYKAQD AKTSRLGPLK RKVILHQEGH MDDGLTLQRC
QREESQAARI IRNTTALFSQ FVSGNNRTAA PITLPIEEVL QTLQDLIAYF
QPPEEEMRHE DKQNKLRSLK NRQNLFKEEG MLALVLNCID RLNVYNSVAH
FAGIAREESG MAWKEILNLL YKLLAALIRG NRNNCAQFSN NLDWLISKLD
RLESSSGILE VLHCILTESP EALNLIAEGH IKSIISLLDK HGRNHKVLDI
LCSLCLCNGV AVRANQNLIC DNLLPRRNLL LQTRLINDVT SIRPNIFLGV
AEGSAQYKKW YFELIIDQVD PFLTAEPTHL RVGWASSSGY APYPGGGEGW
GGNGVGDDLY SYGFDGLHLW SGRIPRAVAS INQHLLRSDD VVSCCLDLGV
PSISFRINGQ PVQGMFENFN TDGLFFPVMS FSAGVKVRFL MGGRHGEFKF
LPPSGYAPCY EALLPKEKMR LEPVKEYKRD ADGIRDLLGT TQFLSQASFI
PCPVDTSQVI LPPHLEKIRD RLAENIHELW GMNKIELGWT FGKIRDDNKR
QHPCLVEFSK LPETEKNYNL QMSTETLKTL LALGCHIAHV NPAAEEDLKK
VKLPKNYMMS NGYKPAPLDL SDVKLLPPQE ILVDKLAENA HNVWAKDRIK
QGWTYGIQQD LKNKRNPRLV PYALLDERTK KSNRDSLREA VRTFVGYGYN
IEPSDQELAD SAVEKVSIDK IRFFRVERSY AVRSGKWYFE FEVVTGGDMR
VGWARPGCRP DVELGADDQA FVFEGNRGQR WHQGSGYFGR TWQPGDVVGC
MINLDDASMI FTLNGELLIT NKGSELAFAD YEIENGFVPI CCLGLSQIGR
MNLGTDASTF KFYTMCGLQE GFEPFAVNMN RDVAMWFSKR LPTFVNVPKD
HPHIEVMRID GTMDSPPCLK VTHKTFGTQN SNADMIYCRL SMPVECHSSF
SHSPCLDSEA FQKRKQMQEI LSHTTTQCYY AIRIFAGQDP SCVWVGWVTP
DYHLYSEKFD LNKNCTVTVT LGDERGRVHE SVKRSNCYMV WGGDIVASSQ
RSNRSNVDLE IGCLVDLAMG MLSFSANGKE LGTCYQVEPN TKVFPAVFLQ
PTSTSLFQFE LGKLKNAMPL SAAIFRSEEK NPVPQCPPRL DVQTIQPVLW
SRMPNSFLKV ETERVSERHG WVVQCLEPLQ MMALHIPEEN RCVDILELCE
QEDLMRFHYH TLRLYSAVCA LGNSRVAYAL CSHVDLSQLF YAIDNKYLPG
LLRSGFYDLL ISIHLASAKE RKLMMKNEYI IPITSTTRNI RLFPDESKRH
GLPGVGLRTC LKPGFRFSTP CFVVTGEDHQ KQSPEIPLES LRTKALSMLT
EAVQCSGAHI RDPVGGSVEF QFVPVLKLIG TLLVMGVFDD DDVRQILLLI
DPSVFGEHSA GTEEGAEKEE VTQVEEKAVE AGEKAGKEAP VKGLLQTRLP
ESVKLQMCEL LSYLCDCELQ HRVEAIVAFG DIYVSKLQAN QKFRYNELMQ
ALNMSAALTA RKTKEFRSPP QEQINMLLNF QLGENCPCPE EIREELYDFH
EDLLLHCGVP LEEEEEEEED TSWTGKLCAL VYKIKGPPKP EKEQPTEEEE
RCPTTLKELI SQTMICWAQE DQIQDSELVR MMFNLLRRQY DSIGELLQAL
RKTYTISHTS VSDTINLLAA LGQIRSLLSV RMGKEEELLM INGLGDIMNN
KVFYQHPNLM RVLGMHETVM EVMVNVLGTE KSQIAFPKMV ASCCRFLCYF
CRISRQNQKA MFEHLSYLLE NSSVGLASPS MRGSTPLDVA ASSVMDNNEL
ALSLEEPDLE KVVTYLAGCG LQSCPMLLAK GYPDVGWNPI EGERYLSFLR
FAVFVNSESV EENASVVVKL LIRRPECFGP ALRGEGGNGL LAAMQGAIKI
SENPALDLPS QGYKREVSTG DDEEEEEIVH MGNAIMSFYS ALIDLLGRCA
PEMHLIQTGK GEAIRIRSIL RSLVPTEDLV GIISIPLKLP SLNKDGSVSE
PDMAANFCPD HKAPMVLFLD RVYGIKDQTF LLHLLEVGFL PDLRASASLD
TVSLSTTEAA LALNRYICSA VLPLLTRCAP LFAGTEHCTS LIDSTLQTIY
RLSKGRSLTK AQRDTIEECL LAICNHLRPS MLQQLLRRLV FDVPQLNEYC
KMPLKLLTNH YEQCWKYYCL PSGWGSYGLA VEEELHLTEK LFWGIFDSLS
HKKYDPDLFR MALPCLSAIA GALPPDYLDT RITATLEKQI SVDADGNFDP
KPINTMNFSL PEKLEYIVTK YAEHSHDKWA CDKSQSGWKY GISLDENVKT
HPLIRPFKTL TEKEKEIYRW PARESLKTML AVGWTVERTK EGEALVQQRE
NEKLRSVSQA NQGNSYSPAP LDLSNVVLSR ELQGMVEVVA ENYHNIWAKK
KKLELESKGG GSHPLLVPYD TLTAKEKFKD REKAQDLFKF LQVNGIIVSR
GMKDMELDAS SMEKRFAYKF LKKILKYVDS AQEFIAHLEA IVSSGKTEKS
PRDQEIKFFA KVLLPLVDQY FTSHCLYFLS SPLKPLSSSG YASHKEKEMV
AGLFCKLAAL VRHRISLFGS DSTTMVSCLH ILAQTLDTRT VMKSGSELVK
AGLRAFFENA AEDLEKTSEN LKLGKFTHSR TQIKGVSQNI NYTTVALLPI
LTSIFEHVTQ HQFGMDLLLG DVQISCYHIL CSLYSLGTGK NIYVERQRPA
LGECLASLAA AIPVAFLEPT LNRYNPLSVF NTKTPRERSI LGMPDTVEDM
CPDIPQLEGL MKEINDLAES GARYTEMPHV IEVILPMLCN YLSYWWERGP
ENLPPSTGPC CTKVTSEHLS LILGNILKII NNNLGIDEAS WMKRIAVYAQ
PIISKARPDL LRSHFIPTLE KLKKKAVKTV QEEEQLKADG KGDTQEAELL
ILDEFAVLCR DLYAFYPMLI RYVDNNRSNW LKSPDADSDQ LFRMVAEVFI
LWCKSHNFKR EEQNFVIQNE INNLAFLTGD SKSKMSKAMQ VKSGGQDQER
KKTKRRGDLY SIQTSLIVAA LKKMLPIGLN MCTPGDQELI SLAKSRYSHR
DTDEEVREHL RNNLHLQEKS DDPAVKWQLN LYKDVLKSEE PFNPEKTVER
VQRISAAVFH LEQVEQPLRS KKAVWHKLLS KQRKRAVVAC FRMAPLYNLP
RHRSINLFLH GYQRFWIETE EYSFEEKLVQ DLAKSPKVEE EEEEETEKQP
DPLHQIILYF SRNALTERSK LEDDPLYTSY SSMMAKSCQS GEDEEEDEDK
EKTFEEKEME KQKTLYQQAR LHERGAAEMV LQMISASKGE MSPMVVETLK
LGIAILNGGN AGVQQKMLDY LKEKKDAGFF QSLSGLMQSC SVLDLNAFER
QNKAEGLGMV TEEGTLIVRE RGEKVLQNDE FTRDLFRFLQ LLCEGHNSDF
QNFLRTQMGN TTTVNVIIST VDYLLRLQES ISDFYWYYSG KDIIDESGQH
NFSKALAVTK QIFNSLTEYI QGPCIGNQQS LAHSRLWDAV VGFLHVFANM
QMKLSQDSSQ IELLKELLDL LQDMVVMLLS LLEGNVVNGT IGKQMVDTLV
ESSTNVEMIL KFFDMFLKLK DLTSSDTFKE YDPDGKGIIS KKEFQKAMEG
QKQYTQSEID FLLSCAEADE NDMFNYVDFV DRFHEPAKDI GFNVAVLLTN
LSEHMPNDSR LKCLLDPAES VLNYFEPYLG RIEIMGGAKK IERVYFEISE
SSRTQWEKPQ VKESKRQFIF DVVNEGGEQE KMELFVNFCE DTIFEMQLAS
QISESDSADR PEEEEEDEDS SYVLEIAGEE EEDGSLEPAS AFAMACASVK
RNVTDFLKRA TLKNLRKQYR NVKKMTAKEL VKVLFSFFWM LFVGLFQLLF
TILGGIFQIL WSTVFGGGLV EGAKNIRVTK ILGDMPDPTQ FGIHDDTMEA
ERAEVMEPGI TTELVHFIKG EKGDTDIMSD LFGLHPKKEG SLKHGPEVGL
GDLSEIIGKD EPPTLESTVQ KKRKAQAAEM KAANEAEGKV ESEKADMEDG
EKEDKDKEEE QAEYLWTEVT KKKKRRCGQK VEKPEAFTAN FFKGLEIYQT
KLLHYLARNF YNLRFLALFV AFAINFILLF YKVTEEPLEE ETEDVANLWN
SFNDEEEEEA MVFFVLQEST GYMAPTLRAL AIIHTIISLV CVVGYYCLKV
PLVVFKREKE IARKLEFDGL YITEQPSEDD IKGQWDRLVI NTPSFPNNYW
DKFVKRKVIN KYGDLYGAER IAELLGLDKN ALDFSPVEET KAEAASLVSW
LSSIDMKYHI WKLGVVFTDN SFLYLAWYTT MSVLGHYNNF FFAAHLLDIA
MGFKTLRTIL SSVTHNGKQL VLTVGLLAVV VYLYTVVAFN FFRKFYNKSE
DDDEPDMKCD DMMTCYLFHM YVGVRAGGGI GDEIEDPAGD PYEMYRIVFD
ITFFFFVIVI LLAIIQGLII DAFGELRDQQ EQVREDMETK CFICGIGNDY
FDTTPHGFET HTLQEHNLAN YLFFLMYLIN KDETEHTGQE SYVWKMYQER
CWDFFPAGDC FRKQYEDQLG

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, саркоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

  • Leeb T., Brenig B. (1998). cDNA cloning and sequencing of the human ryanodine receptor type 3 (RYR3) reveals a novel alternative splice site in the RYR3 gene. FEBS Lett. 423: 367—370. PMID 9515741 doi:10.1016/S0014-5793(98)00124-0
  • Martin C., Chapman K.E., Seckl J.R., Ashley R.H. (1998). Partial cloning and differential expression of ryanodine receptor/calcium-release channel genes in human tissues including the hippocampus and cerebellum. Neuroscience. 85: 205—216. PMID 9607712 doi:10.1016/S0306-4522(97)00612-X
  • Sorrentino V., Giannini G., Malzac P., Mattei M.-G. (1993). Localization of a novel ryanodine receptor gene (RYR3) to human chromosome 15q14-q15 by in situ hybridization. Genomics. 18: 163—165. PMID 8276408 doi:10.1006/geno.1993.1446
  • Lynn S., Morgan J.M., Lamb H.K., Meissner G., Gillespie J.I. (1995). Isolation and partial cloning of ryanodine-sensitive Ca2+ release channel protein isoforms from human myometrial smooth muscle. FEBS Lett. 372: 6—12. PMID 7556644 doi:10.1016/0014-5793(95)00924-X
  • Schwarzmann N., Kunerth S., Weber K., Mayr G.W., Guse A.H. (2002). Knock-down of the type 3 ryanodine receptor impairs sustained Ca2+ signaling via the T cell receptor/CD3 complex. J. Biol. Chem. 277: 50636—50642. PMID 12354756 doi:10.1074/jbc.M209061200
  • Yuchi Z., Lau K., Van Petegem F. (2012). Disease mutations in the ryanodine receptor central region: crystal structures of a phosphorylation hot spot domain. Structure. 20: 1201—1211. PMID 22705209 doi:10.1016/j.str.2012.04.015

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з RYR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Ryanodine receptor 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10485 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. UniProt, Q15413 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також