TRPC4AP

TRPC4AP
Ідентифікатори
Символи	TRPC4AP, C20orf188, PPP1R158, TRRP4AP, TRUSS, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein
Зовнішні ІД	OMIM: 608430 MGI: 1930751 HomoloGene: 9224 GeneCards: TRPC4AP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • calcium channel activity;
Клітинна компонента	• клітинна мембрана; • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex;
Біологічний процес	• calcium ion transmembrane transport; • Убіквітин-залежний протеоліз; • hair follicle maturation; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	26133
	56407
	ENSG00000100991
	ENSMUSG00000038324
	Q8TEL6
	Q9JLV2
	NM_015638; NM_199368
	NM_001163452; NM_019828
	NP_056453; NP_955400
	NP_001156924; NP_062802
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRPC4AP (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 90 852^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAPVAAGS	GAGRGRRSAA	TVAAWGGWGG	RPRPGNILLQ	LRQGQLTGRG
LVRAVQFTET	FLTERDKQSK	WSGIPQLLLK	LHTTSHLHSD	FVECQNILKE
ISPLLSMEAM	AFVTEERKLT	QETTYPNTYI	FDLFGGVDLL	VEILMRPTIS
IRGQKLKISD	EMSKDCLSIL	YNTCVCTEGV	TKRLAEKNDF	VIFLFTLMTS
KKTFLQTATL	IEDILGVKKE	MIRLDEVPNL	SSLVSNFDQQ	QLANFCRILA
VTISEMDTGN	DDKHTLLAKN	AQQKKSLSLG	PSAAEINQAA	LLSIPGFVER
LCKLATRKVS	ESTGTASFLQ	ELEEWYTWLD	NALVLDALMR	VANEESEHNQ
ASIVFPPPGA	SEENGLPHTS	ARTQLPQSMK	IMHEIMYKLE	VLYVLCVLLM
GRQRNQVHRM	IAEFKLIPGL	NNLFDKLIWR	KHSASALVLH	GHNQNCDCSP
DITLKIQFLR	LLQSFSDHHE	NKYLLLNNQE	LNELSAISLK	ANIPEVEAVL
NTDRSLVCDG	KRGLLTRLLQ	VMKKEPAESS	FRFWQARAVE	SFLRGTTSYA
DQMFLLKRGL	LEHILYCIVD	SECKSRDVLQ	SYFDLLGELM	KFNVDAFKRF
NKYINTDAKF	QVFLKQINSS	LVDSNMLVRC	VTLSLDRFEN	QVDMKVAEVL
SECRLLAYIS	QVPTQMSFLF	RLINIIHVQT	LTQENVSCLN	TSLVILMLAR
RKERLPLYLR	LLQRMEHSKK	YPGFLLNNFH	NLLRFWQQHY	LHKDKDSTCL
ENSSCISFSY	WKETVSILLN	PDRQSPSALV	SYIEEPYMDI	DRDFTEE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Choi S.H., Wright J.B., Gerber S.A., Cole M.D. (2010). Myc protein is stabilized by suppression of a novel E3 ligase complex in cancer cells. Genes Dev. 24: 1236—1241. PMID 20551172 doi:10.1101/gad.1920310
Li T., Robert E.I., van Breugel P.C., Strubin M., Zheng N. (2010). A promiscuous alpha-helical motif anchors viral hijackers and substrate receptors to the CUL4-DDB1 ubiquitin ligase machinery. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 105—111. PMID 19966799 doi:10.1038/nsmb.1719

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16181 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q8TEL6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16181 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q8TEL6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]