CLCN3

CLCN3
Ідентифікатори
Символи	CLCN3, CLC3, ClC-3, chloride voltage-gated channel 3, NEDSBA, NEDHYBA
Зовнішні ІД	OMIM: 600580 MGI: 103555 HomoloGene: 20435 GeneCards: CLCN3
Реагує на сполуку
	phloretin
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • volume-sensitive chloride channel activity; • PDZ domain binding; • protein homodimerization activity; • ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • antiporter activity; • ATP binding; • chloride channel activity; • voltage-gated chloride channel activity; • solute:proton antiporter activity; • chloride ion binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • ендосома; • late endosome; • комплекс Ґольджі; • early endosome membrane; • мембрана; • late endosome membrane; • Синаптичні бульбашки; • vesicle membrane; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • секреторна гранула; • cell surface; • early endosome; • specific granule; • phagocytic vesicle; • external side of plasma membrane; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• negative regulation of cell volume; • endosomal lumen acidification; • ion transport; • regulation of anion transmembrane transport; • chloride transport; • regulation of pH; • chloride transmembrane transport; • regulation of anion transport; • трансмембранний транспорт; • GO:0015915 транспорт; • synaptic vesicle lumen acidification;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1182
	12725
	ENSG00000109572
	ENSMUSG00000004319
	P51790
	P51791
	NM_001243372; NM_001243374; NM_001829; NM_173872
	NM_007711; NM_173873; NM_173874; NM_173876
	NP_001230301; NP_001230303; NP_001820; NP_776297
	NP_031737; NP_776298; NP_776299; NP_776301
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLCN3 (англ. Chloride voltage-gated channel 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 818 амінокислот, а молекулярна маса — 90 966^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESEQLFHRG	YYRNSYNSIT	SASSDEELLD	GAGVIMDFQT	SEDDNLLDGD
TAVGTHYTMT	NGGSINSSTH	LLDLLDEPIP	GVGTYDDFHT	IDWVREKCKD
RERHRRINSK	KKESAWEMTK	SLYDAWSGWL	VVTLTGLASG	ALAGLIDIAA
DWMTDLKEGI	CLSALWYNHE	QCCWGSNETT	FEERDKCPQW	KTWAELIIGQ
AEGPGSYIMN	YIMYIFWALS	FAFLAVSLVK	VFAPYACGSG	IPEIKTILSG
FIIRGYLGKW	TLMIKTITLV	LAVASGLSLG	KEGPLVHVAC	CCGNIFSYLF
PKYSTNEAKK	REVLSAASAA	GVSVAFGAPI	GGVLFSLEEV	SYYFPLKTLW
RSFFAALVAA	FVLRSINPFG	NSRLVLFYVE	YHTPWYLFEL	FPFILLGVFG
GLWGAFFIRA	NIAWCRRRKS	TKFGKYPVLE	VIIVAAITAV	IAFPNPYTRL
NTSELIKELF	TDCGPLESSS	LCDYRNDMNA	SKIVDDIPDR	PAGIGVYSAI
WQLCLALIFK	IIMTVFTFGI	KVPSGLFIPS	MAIGAIAGRI	VGIAVEQLAY
YHHDWFIFKE	WCEVGADCIT	PGLYAMVGAA	ACLGGVTRMT	VSLVVIVFEL
TGGLEYIVPL	MAAVMTSKWV	GDAFGREGIY	EAHIRLNGYP	FLDAKEEFTH
TTLAADVMRP	RRNDPPLAVL	TQDNMTVDDI	ENMINETSYN	GFPVIMSKES
QRLVGFALRR	DLTIAIESAR	KKQEGIVGSS	RVCFAQHTPS	LPAESPRPLK
LRSILDMSPF	TVTDHTPMEI	VVDIFRKLGL	RQCLVTHNGR	LLGIITKKDI
LRHMAQTANQ	DPASIMFN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, хлоридом. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Borsani G., Rugarli E.I., Taglialatela M., Wong C., Ballabio A. (1995). Characterization of a human and murine gene (CLCN3) sharing similarities to voltage-gated chloride channels and to a yeast integral membrane protein. Genomics. 27: 131—141. PMID 7665160 doi:10.1006/geno.1995.1015
Shepard A.R., Rae J.L. (1998). Ion transporters and receptors in cDNA libraries from lens and cornea epithelia. Curr. Eye Res. 17: 708—719. PMID 9678416 doi:10.1080/02713689808951247
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride voltage-gated channel 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2021 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-16 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P51790 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride voltage-gated channel 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2021 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-16 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P51790 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]