TPCN2

TPCN2
Ідентифікатори
Символи	TPCN2, SHEP10, TPC2, two pore segment channel 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612163 MGI: 2385297 HomoloGene: 16375 GeneCards: TPCN2
Реагує на сполуку
	phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium channel activity; • voltage-gated ion channel activity; • ion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • protein kinase binding; • NAADP-sensitive calcium-release channel activity; • voltage-gated calcium channel activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • endosome membrane; • лізосома; • lysosomal membrane;
Біологічний процес	• release of sequestered calcium ion into cytosol; • membrane depolarization during action potential; • response to vitamin D; • regulation of ion transmembrane transport; • cellular calcium ion homeostasis; • ion transport; • ion transmembrane transport; • regulation of autophagy; • calcium ion transmembrane transport; • lysosome organization; • calcium-mediated signaling; • calcium ion transport; • трансмембранний транспорт; • smooth muscle contraction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	219931
	233979
	ENSG00000162341
	ENSMUSG00000048677
	Q8NHX9
	Q8BWC0
	NM_139075
	NM_146206
	NP_620714
	NP_666318
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TPCN2 (англ. Two pore segment channel 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 752 амінокислот, а молекулярна маса — 85 243^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEPQAESEP	LLGGARGGGG	DWPAGLTTYR	SIQVGPGAAA	RWDLCIDQAV
VFIEDAIQYR	SINHRVDASS	MWLYRRYYSN	VCQRTLSFTI	FLILFLAFIE
TPSSLTSTAD	VRYRAAPWEP	PCGLTESVEV	LCLLVFAADL	SVKGYLFGWA
HFQKNLWLLG	YLVVLVVSLV	DWTVSLSLVC	HEPLRIRRLL	RPFFLLQNSS
MMKKTLKCIR	WSLPEMASVG	LLLAIHLCLF	TMFGMLLFAG	GKQDDGQDRE
RLTYFQNLPE	SLTSLLVLLT	TANNPDVMIP	AYSKNRAYAI	FFIVFTVIGS
LFLMNLLTAI	IYSQFRGYLM	KSLQTSLFRR	RLGTRAAFEV	LSSMVGEGGA
FPQAVGVKPQ	NLLQVLQKVQ	LDSSHKQAMM	EKVRSYGSVL	LSAEEFQKLF
NELDRSVVKE	HPPRPEYQSP	FLQSAQFLFG	HYYFDYLGNL	IALANLVSIC
VFLVLDADVL	PAERDDFILG	ILNCVFIVYY	LLEMLLKVFA	LGLRGYLSYP
SNVFDGLLTV	VLLVLEISTL	AVYRLPHPGW	RPEMVGLLSL	WDMTRMLNML
IVFRFLRIIP	SMKLMAVVAS	TVLGLVQNMR	AFGGILVVVY	YVFAIIGINL
FRGVIVALPG	NSSLAPANGS	APCGSFEQLE	YWANNFDDFA	AALVTLWNLM
VVNNWQVFLD	AYRRYSGPWS	KIYFVLWWLV	SSVIWVNLFL	ALILENFLHK
WDPRSHLQPL	AGTPEATYQM	TVELLFRDIL	EEPGEDELTE	RLSQHPHLWL
CR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Lam A.K., Galione A., Lai F.A., Zissimopoulos S. (2013). Hax-1 identified as a two-pore channel (TPC)-binding protein. FEBS Lett. 587: 3782—3786. PMID 24188827 doi:10.1016/j.febslet.2013.10.031

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Two pore segment channel 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20820 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8NHX9 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Two pore segment channel 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20820 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q8NHX9 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]