HCN4

HCN4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи HCN4, SSS2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, BRGDA8, EIG18
Зовнішні ІД OMIM: 605206 MGI: 1298209 HomoloGene: 3997 GeneCards: HCN4
Пов'язані генетичні захворювання
Brugada syndrome 8, миготіння передсердь[1]
Реагує на сполуку
івабрадин[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10021
330953
Ensembl
ENSG00000138622
ENSMUSG00000032338
UniProt
Q9Y3Q4
O70507
RefSeq (мРНК)
NM_005477
NM_001081192
RefSeq (білок)
NP_005468
NP_001074661
Локус (UCSC) Хр. 15: 73.32 – 73.37 Mb Хр. 9: 58.73 – 58.77 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HCN4 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 203 амінокислот, а молекулярна маса — 129 042[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDKLPPSMRK RLYSLPQQVG AKAWIMDEEE DAEEEGAGGR QDPSRRSIRL
RPLPSPSPSA AAGGTESRSS ALGAADSEGP ARGAGKSSTN GDCRRFRGSL
ASLGSRGGGS GGTGSGSSHG HLHDSAEERR LIAEGDASPG EDRTPPGLAA
EPERPGASAQ PAASPPPPQQ PPQPASASCE QPSVDTAIKV EGGAAAGDQI
LPEAEVRLGQ AGFMQRQFGA MLQPGVNKFS LRMFGSQKAV EREQERVKSA
GFWIIHPYSD FRFYWDLTML LLMVGNLIII PVGITFFKDE NTTPWIVFNV
VSDTFFLIDL VLNFRTGIVV EDNTEIILDP QRIKMKYLKS WFMVDFISSI
PVDYIFLIVE TRIDSEVYKT ARALRIVRFT KILSLLRLLR LSRLIRYIHQ
WEEIFHMTYD LASAVVRIVN LIGMMLLLCH WDGCLQFLVP MLQDFPDDCW
VSINNMVNNS WGKQYSYALF KAMSHMLCIG YGRQAPVGMS DVWLTMLSMI
VGATCYAMFI GHATALIQSL DSSRRQYQEK YKQVEQYMSF HKLPPDTRQR
IHDYYEHRYQ GKMFDEESIL GELSEPLREE IINFNCRKLV ASMPLFANAD
PNFVTSMLTK LRFEVFQPGD YIIREGTIGK KMYFIQHGVV SVLTKGNKET
KLADGSYFGE ICLLTRGRRT ASVRADTYCR LYSLSVDNFN EVLEEYPMMR
RAFETVALDR LDRIGKKNSI LLHKVQHDLN SGVFNYQENE IIQQIVQHDR
EMAHCAHRVQ AAASATPTPT PVIWTPLIQA PLQAAAATTS VAIALTHHPR
LPAAIFRPPP GSGLGNLGAG QTPRHLKRLQ SLIPSALGSA SPASSPSQVD
TPSSSSFHIQ QLAGFSAPAG LSPLLPSSSS SPPPGACGSP SAPTPSAGVA
ATTIAGFGHF HKALGGSLSS SDSPLLTPLQ PGARSPQAAQ PSPAPPGARG
GLGLPEHFLP PPPSSRSPSS SPGQLGQPPG ELSLGLATGP LSTPETPPRQ
PEPPSLVAGA SGGASPVGFT PRGGLSPPGH SPGPPRTFPS APPRASGSHG
SLLLPPASSP PPPQVPQRRG TPPLTPGRLT QDLKLISASQ PALPQDGAQT
LRRASPHSSG ESMAAFPLFP RAGGGSGGSG SSGGLGPPGR PYGAIPGQHV
TLPRKTSSGS LPPPLSLFGA RATSSGGPPL TAGPQREPGA RPEPVRSKLP
SNL

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Xu X., Vysotskaya Z.V., Liu Q., Zhou L. (2010). Structural basis for the cAMP-dependent gating in the human HCN4 channel. J. Biol. Chem. 285: 37082—37091. PMID 20829353 doi:10.1074/jbc.M110.152033
  • Milanesi R., Baruscotti M., Gnecchi-Ruscone T., DiFrancesco D. (2006). Familial sinus bradycardia associated with a mutation in the cardiac pacemaker channel. N. Engl. J. Med. 354: 151—157. PMID 16407510 doi:10.1056/NEJMoa052475

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з HCN4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16882 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. UniProt, Q9Y3Q4 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також