TRPM2

TRPM2
Ідентифікатори
Символи	TRPM2, Trpm2, 9830168K16Rik, C79133, LTRPC2, TRPC7, Trp7, Trrp7, EREG1, KNP3, NUDT9H, NUDT9L1, LTrpC-2, transient receptor potential cation channel subfamily M member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603749 MGI: 1351901 HomoloGene: 20709 GeneCards: TRPM2
Реагує на сполуку
	cyclic ADP-ribose, Перекис водню, NAADP, Арахідонова кислота, 2-aminoethoxydiphenylborate, клотримазол, Еконазол, flufenamic acid, міконазол, гідрон
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium channel activity; • sodium channel activity; • ion channel activity; • cation channel activity; • calcium ion binding; • calcium-release channel activity; • hydrolase activity; • ligand-gated calcium channel activity; • зв’язування з іоном металу; • ADP-ribose diphosphatase activity; • mono-ADP-D-ribose binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • лізосома; • lysosomal membrane; • integral component of plasma membrane; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • specific granule membrane; • cell projection; • перикаріон; • tertiary granule membrane; • ficolin-1-rich granule membrane;
Біологічний процес	• sodium ion transmembrane transport; • sodium ion transport; • cation transport; • ion transport; • GO:0001306 response to oxidative stress; • calcium ion transmembrane transport; • calcium ion transport; • ion transmembrane transport; • трансмембранний транспорт; • temperature homeostasis; • dendritic cell chemotaxis; • response to purine-containing compound; • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source; • neutrophil degranulation; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • regulation of filopodium assembly; • cellular response to hydrogen peroxide; • cellular response to calcium ion; • cellular response to purine-containing compound; • cellular response to temperature stimulus; • zinc ion transmembrane transport; • dendritic cell differentiation; • GO:0060401 calcium ion transmembrane import into cytosol; • regulation of actin cytoskeleton reorganization; • calcium ion import across plasma membrane; • protein homotetramerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7226
	28240
	ENSG00000142185
	ENSMUSG00000009292
	O94759
	Q91YD4
	NM_001001188; NM_003307; NM_001320350; NM_001320351; NM_001320352
	NM_138301
	NP_001307279; NP_001307280; NP_001307281; NP_003298
	NP_612174
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRPM2 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 503 амінокислот, а молекулярна маса — 171 198^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPSALRKAG	SEQEEGFEGL	PRRVTDLGMV	SNLRRSNSSL	FKSWRLQCPF
GNNDKQESLS	SWIPENIKKK	ECVYFVESSK	LSDAGKVVCQ	CGYTHEQHLE
EATKPHTFQG	TQWDPKKHVQ	EMPTDAFGDI	VFTGLSQKVK	KYVRVSQDTP
SSVIYHLMTQ	HWGLDVPNLL	ISVTGGAKNF	NMKPRLKSIF	RRGLVKVAQT
TGAWIITGGS	HTGVMKQVGE	AVRDFSLSSS	YKEGELITIG	VATWGTVHRR
EGLIHPTGSF	PAEYILDEDG	QGNLTCLDSN	HSHFILVDDG	THGQYGVEIP
LRTRLEKFIS	EQTKERGGVA	IKIPIVCVVL	EGGPGTLHTI	DNATTNGTPC
VVVEGSGRVA	DVIAQVANLP	VSDITISLIQ	QKLSVFFQEM	FETFTESRIV
EWTKKIQDIV	RRRQLLTVFR	EGKDGQQDVD	VAILQALLKA	SRSQDHFGHE
NWDHQLKLAV	AWNRVDIARS	EIFMDEWQWK	PSDLHPTMTA	ALISNKPEFV
KLFLENGVQL	KEFVTWDTLL	YLYENLDPSC	LFHSKLQKVL	VEDPERPACA
PAAPRLQMHH	VAQVLRELLG	DFTQPLYPRP	RHNDRLRLLL	PVPHVKLNVQ
GVSLRSLYKR	SSGHVTFTMD	PIRDLLIWAI	VQNRRELAGI	IWAQSQDCIA
AALACSKILK	ELSKEEEDTD	SSEEMLALAE	EYEHRAIGVF	TECYRKDEER
AQKLLTRVSE	AWGKTTCLQL	ALEAKDMKFV	SHGGIQAFLT	KVWWGQLSVD
NGLWRVTLCM	LAFPLLLTGL	ISFREKRLQD	VGTPAARARA	FFTAPVVVFH
LNILSYFAFL	CLFAYVLMVD	FQPVPSWCEC	AIYLWLFSLV	CEEMRQLFYD
PDECGLMKKA	ALYFSDFWNK	LDVGAILLFV	AGLTCRLIPA	TLYPGRVILS
LDFILFCLRL	MHIFTISKTL	GPKIIIVKRM	MKDVFFFLFL	LAVWVVSFGV
AKQAILIHNE	RRVDWLFRGA	VYHSYLTIFG	QIPGYIDGVN	FNPEHCSPNG
TDPYKPKCPE	SDATQQRPAF	PEWLTVLLLC	LYLLFTNILL	LNLLIAMFNY
TFQQVQEHTD	QIWKFQRHDL	IEEYHGRPAA	PPPFILLSHL	QLFIKRVVLK
TPAKRHKQLK	NKLEKNEEAA	LLSWEIYLKE	NYLQNRQFQQ	KQRPEQKIED
ISNKVDAMVD	LLDLDPLKRS	GSMEQRLASL	EEQVAQTAQA	LHWIVRTLRA
SGFSSEADVP	TLASQKAAEE	PDAEPGGRKK	TEEPGDSYHV	NARHLLYPNC
PVTRFPVPNE	KVPWETEFLI	YDPPFYTAER	KDAAAMDPMG	DTLEPLSTIQ
YNVVDGLRDR	RSFHGPYTVQ	AGLPLNPMGR	TGLRGRGSLS	CFGPNHTLYP
MVTRWRRNED	GAICRKSIKK	MLEVLVVKLP	LSEHWALPGG	SREPGEMLPR
KLKRILRQEH	WPSFENLLKC	GMEVYKGYMD	DPRNTDNAWI	ETVAVSVHFQ
DQNDVELNRL	NSNLHACDSG	ASIRWQVVDR	RIPLYANHKT	LLQKAAAEFG
AHY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт натрію, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, лізосомі.

Література

Uemura T., Kudoh J., Noda S., Kanba S., Shimizu N. (2005). Characterization of human and mouse TRPM2 genes: identification of a novel N-terminal truncated protein specifically expressed in human striatum. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 1232—1243. PMID 15708008 doi:10.1016/j.bbrc.2005.01.086
Csanady L., Toerocsik B. (2009). Four Ca2+ ions activate TRPM2 channels by binding in deep crevices near the pore but intracellularly of the gate. J. Gen. Physiol. 133: 189—203. PMID 19171771 doi:10.1085/jgp.200810109
Toth B., Csanady L. (2010). Identification of direct and indirect effectors of the transient receptor potential melastatin 2 (TRPM2) cation channel. J. Biol. Chem. 285: 30091—30102. PMID 20650899 doi:10.1074/jbc.M109.066464
Toth B., Iordanov I., Csanady L. (2015). Ruling out pyridine dinucleotides as true TRPM2 channel activators reveals novel direct agonist ADP-ribose-2'-phosphate. J. Gen. Physiol. 145: 419—430. PMID 25918360 doi:10.1085/jgp.201511377
Iordanov I., Mihalyi C., Toth B., Csanady L. (2016). The proposed channel-enzyme transient receptor potential melastatin 2 does not possess ADP ribose hydrolase activity. Elife. 5: —. PMID 27383051 doi:10.7554/eLife.17600
Li F., Abuarab N., Sivaprasadarao A. (2016). Reciprocal regulation of actin cytoskeleton remodelling and cell migration by Ca2+ and Zn2+: role of TRPM2 channels. J. Cell Sci. 129: 2016—2029. PMID 27068538 doi:10.1242/jcs.179796

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12339 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O94759 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 21

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12339 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, O94759 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]