KCNIP1

KCNIP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1S1E, 2I2R, 2NZ0
Ідентифікатори
Символи	KCNIP1, KCHIP1, VABP, potassium voltage-gated channel interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604660 MGI: 1917607 HomoloGene: 22824 GeneCards: KCNIP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • potassium channel regulator activity; • potassium channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування з іоном металу; • voltage-gated ion channel activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • voltage-gated potassium channel complex; • клітинна мембрана; • cell projection; • дендрит (нейробіологія); • мембрана;
Біологічний процес	• potassium ion transport; • regulation of ion transmembrane transport; • ion transport; • regulation of potassium ion transmembrane transport; • potassium ion transmembrane transport; • cardiac conduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	30820
	70357
	ENSG00000182132
	ENSMUSG00000053519
	Q9NZI2
	Q9JJ57
	NM_001034837; NM_001034838; NM_001278339; NM_001278340; NM_014592
	NM_001190885; NM_001190886; NM_001290690; NM_027398; NM_001363115
	NP_001030009; NP_001030010; NP_001265268; NP_001265269; NP_055407
	NP_001177814; NP_001177815; NP_001277619; NP_081674; NP_001350044
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KCNIP1 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 26 817^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAVMGTFSS	LQTKQRRPSK	DIAWWYYQYQ	RDKIEDELEM	TMVCHRPEGL
EQLEAQTNFT	KRELQVLYRG	FKNECPSGVV	NEDTFKQIYA	QFFPHGDAST
YAHYLFNAFD	TTQTGSVKFE	DFVTALSILL	RGTVHEKLRW	TFNLYDINKD
GYINKEEMMD	IVKAIYDMMG	KYTYPVLKED	TPRQHVDVFF	QKMDKNKDGI
VTLDEFLESC	QEDDNIMRSL	QLFQNVM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 doi:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Van Hoorick D., Raes A., Keysers W., Mayeur E., Snyders D.J. (2003). Differential modulation of Kv4 kinetics by KCHIP1 splice variants. Mol. Cell. Neurosci. 24: 357—366. PMID 14572458 doi:10.1016/S1044-7431(03)00174-X
Lin Y.-L., Lin S.-R., Wu T.T., Chang L.-S. (2004). Evidence showing an intermolecular interaction between KChIP proteins and Taiwan cobra cardiotoxins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319: 720—724. PMID 15184042 doi:10.1016/j.bbrc.2004.05.064
Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
Pioletti M., Findeisen F., Hura G.L., Minor D.L. Jr. (2006). Three-dimensional structure of the KChIP1-Kv4.3 T1 complex reveals a cross-shaped octamer. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 987—995. PMID 17057713 doi:10.1038/nsmb1164

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15521 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NZI2 (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2018. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15521 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NZI2 (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2018. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]