ITPR1

ITPR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ITPR1, ACV, CLA4, INSP3R1, IP3R, IP3R1, PPP1R94, SCA15, SCA16, SCA29, inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1
Зовнішні ІД OMIM: 147265 MGI: 96623 HomoloGene: 1673 GeneCards: ITPR1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, spinocerebellar ataxia type 15/16, spinocerebellar ataxia type 29, Gillespie syndrome[1]
Реагує на сполуку
adenophostin A, аденозинтрифосфат, кофеїн[2]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3708
16438
Ensembl
ENSG00000150995
ENSMUSG00000030102
UniProt
Q14643
P11881
RefSeq (мРНК)
NM_001099952
NM_001168272
NM_002222
NM_001378452
NM_010585
RefSeq (білок)
NP_001093422
NP_001161744
NP_002213
NP_034715
Локус (UCSC) Хр. 3: 4.49 – 4.85 Mb Хр. 6: 108.19 – 108.53 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITPR1 (англ. Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 758 амінокислот, а молекулярна маса — 313 929[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSDKMSSFLH IGDICSLYAE GSTNGFISTL GLVDDRCVVQ PETGDLNNPP
KKFRDCLFKL CPMNRYSAQK QFWKAAKPGA NSTTDAVLLN KLHHAADLEK
KQNETENRKL LGTVIQYGNV IQLLHLKSNK YLTVNKRLPA LLEKNAMRVT
LDEAGNEGSW FYIQPFYKLR SIGDSVVIGD KVVLNPVNAG QPLHASSHQL
VDNPGCNEVN SVNCNTSWKI VLFMKWSDNK DDILKGGDVV RLFHAEQEKF
LTCDEHRKKQ HVFLRTTGRQ SATSATSSKA LWEVEVVQHD PCRGGAGYWN
SLFRFKHLAT GHYLAAEVDP DFEEECLEFQ PSVDPDQDAS RSRLRNAQEK
MVYSLVSVPE GNDISSIFEL DPTTLRGGDS LVPRNSYVRL RHLCTNTWVH
STNIPIDKEE EKPVMLKIGT SPVKEDKEAF AIVPVSPAEV RDLDFANDAS
KVLGSIAGKL EKGTITQNER RSVTKLLEDL VYFVTGGTNS GQDVLEVVFS
KPNRERQKLM REQNILKQIF KLLQAPFTDC GDGPMLRLEE LGDQRHAPFR
HICRLCYRVL RHSQQDYRKN QEYIAKQFGF MQKQIGYDVL AEDTITALLH
NNRKLLEKHI TAAEIDTFVS LVRKNREPRF LDYLSDLCVS MNKSIPVTQE
LICKAVLNPT NADILIETKL VLSRFEFEGV SSTGENALEA GEDEEEVWLF
WRDSNKEIRS KSVRELAQDA KEGQKEDRDV LSYYRYQLNL FARMCLDRQY
LAINEISGQL DVDLILRCMS DENLPYDLRA SFCRLMLHMH VDRDPQEQVT
PVKYARLWSE IPSEIAIDDY DSSGASKDEI KERFAQTMEF VEEYLRDVVC
QRFPFSDKEK NKLTFEVVNL ARNLIYFGFY NFSDLLRLTK ILLAILDCVH
VTTIFPISKM AKGEENKGNN DVEKLKSSNV MRSIHGVGEL MTQVVLRGGG
FLPMTPMAAA PEGNVKQAEP EKEDIMVMDT KLKIIEILQF ILNVRLDYRI
SCLLCIFKRE FDESNSQTSE TSSGNSSQEG PSNVPGALDF EHIEEQAEGI
FGGSEENTPL DLDDHGGRTF LRVLLHLTMH DYPPLVSGAL QLLFRHFSQR
QEVLQAFKQV QLLVTSQDVD NYKQIKQDLD QLRSIVEKSE LWVYKGQGPD
ETMDGASGEN EHKKTEEGNN KPQKHESTSS YNYRVVKEIL IRLSKLCVQE
SASVRKSRKQ QQRLLRNMGA HAVVLELLQI PYEKAEDTKM QEIMRLAHEF
LQNFCAGNQQ NQALLHKHIN LFLNPGILEA VTMQHIFMNN FQLCSEINER
VVQHFVHCIE THGRNVQYIK FLQTIVKAEG KFIKKCQDMV MAELVNSGED
VLVFYNDRAS FQTLIQMMRS ERDRMDENSP LMYHIHLVEL LAVCTEGKNV
YTEIKCNSLL PLDDIVRVVT HEDCIPEVKI AYINFLNHCY VDTEVEMKEI
YTSNHMWKLF ENFLVDICRA CNNTSDRKHA DSILEKYVTE IVMSIVTTFF
SSPFSDQSTT LQTRQPVFVQ LLQGVFRVYH CNWLMPSQKA SVESCIRVLS
DVAKSRAIAI PVDLDSQVNN LFLKSHSIVQ KTAMNWRLSA RNAARRDSVL
AASRDYRNII ERLQDIVSAL EDRLRPLVQA ELSVLVDVLH RPELLFPENT
DARRKCESGG FICKLIKHTK QLLEENEEKL CIKVLQTLRE MMTKDRGYGE
KLISIDELDN AELPPAPDSE NATEELEPSP PLRQLEDHKR GEALRQVLVN
RYYGNVRPSG RRESLTSFGN GPLSAGGPGK PGGGGGGSGS SSMSRGEMSL
AEVQCHLDKE GASNLVIDLI MNASSDRVFH ESILLAIALL EGGNTTIQHS
FFCRLTEDKK SEKFFKVFYD RMKVAQQEIK ATVTVNTSDL GNKKKDDEVD
RDAPSRKKAK EPTTQITEEV RDQLLEASAA TRKAFTTFRR EADPDDHYQP
GEGTQATADK AKDDLEMSAV ITIMQPILRF LQLLCENHNR DLQNFLRCQN
NKTNYNLVCE TLQFLDCICG STTGGLGLLG LYINEKNVAL INQTLESLTE
YCQGPCHENQ NCIATHESNG IDIITALILN DINPLGKKRM DLVLELKNNA
SKLLLAIMES RHDSENAERI LYNMRPKELV EVIKKAYMQG EVEFEDGENG
EDGAASPRNV GHNIYILAHQ LARHNKELQS MLKPGGQVDG DEALEFYAKH
TAQIEIVRLD RTMEQIVFPV PSICEFLTKE SKLRIYYTTE RDEQGSKIND
FFLRSEDLFN EMNWQKKLRA QPVLYWCARN MSFWSSISFN LAVLMNLLVA
FFYPFKGVRG GTLEPHWSGL LWTAMLISLA IVIALPKPHG IRALIASTIL
RLIFSVGLQP TLFLLGAFNV CNKIIFLMSF VGNCGTFTRG YRAMVLDVEF
LYHLLYLVIC AMGLFVHEFF YSLLLFDLVY REETLLNVIK SVTRNGRSII
LTAVLALILV YLFSIVGYLF FKDDFILEVD RLPNETAVPE TGESLASEFL
FSDVCRVESG ENCSSPAPRE ELVPAEETEQ DKEHTCETLL MCIVTVLSHG
LRSGGGVGDV LRKPSKEEPL FAARVIYDLL FFFMVIIIVL NLIFGVIIDT
FADLRSEKQK KEEILKTTCF ICGLERDKFD NKTVTFEEHI KEEHNMWHYL
CFIVLVKVKD STEYTGPESY VAEMIKERNL DWFPRMRAMS LVSSDSEGEQ
NELRNLQEKL ESTMKLVTNL SGQLSELKDQ MTEQRKQKQR IGLLGHPPHM
NVNPQQPA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

  • Nucifora F.C. Jr., Li S.-H., Danoff S., Ullrich A., Ross C.A. (1995). Molecular cloning of a cDNA for the human inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1, and the identification of a third alternatively spliced variant. Brain Res. Mol. Brain Res. 32: 291—296. PMID 7500840 doi:10.1016/0169-328X(95)00089-B
  • Yan J., Khanna K.K., Lavin M.F. (1996). Induction of inositol 1,4,5 trisphosphate receptor genes by ionizing radiation. Int. J. Radiat. Biol. 69: 539—546. PMID 8648241 doi:10.1080/095530096145544
  • Ando H., Mizutani A., Mikoshiba K. (2009). An IRBIT homologue lacks binding activity to inositol 1,4,5-trisphosphate receptor due to the unique N-terminal appendage. J. Neurochem. 109: 539—550. PMID 19220705 doi:10.1111/j.1471-4159.2009.05979.x
  • Schulman J.J., Wright F.A., Kaufmann T., Wojcikiewicz R.J. (2013). The Bcl-2 protein family member Bok binds to the coupling domain of inositol 1,4,5-trisphosphate receptors and protects them from proteolytic cleavage. J. Biol. Chem. 288: 25340—25349. PMID 23884412 doi:10.1074/jbc.M113.496570

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ITPR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6180 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. UniProt, Q14643 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також