SCN10A

SCN10A
Ідентифікатори
Символи SCN10A, FEPS2, Nav1.8, PN3, SNS, hPN3, sodium voltage-gated channel alpha subunit 10
Зовнішні ІД OMIM: 604427 MGI: 108029 HomoloGene: 21300 GeneCards: SCN10A
Пов'язані генетичні захворювання
миготіння передсердь[1]
Реагує на сполуку
mephenytoin, dibucaine hydrochloride, indecainide, oxybuprocaine, окскарбазепін, Irampanel, dichlorobenzyl alcohol, priralfinamide, Evenamide, лідокаїн, зонісамід, топірамат, chloroprocaine hydrochloride, eslicarbazepine, quinidine gluconate, disopyramide phosphate, dyclonine hydrochloride, mepivacaine hydrochloride, (RS)-mexiletine hydrochloride, orphenadrine citrate, procainamide hydrochloride, propafenone hydrochloride, benoxinate hydrochloride, prilocaine hydrochloride[2]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6336
20264
Ensembl
ENSG00000185313
ENSMUSG00000034533
UniProt
Q9Y5Y9
Q6QIY3
RefSeq (мРНК)
NM_001293306
NM_001293307
NM_006514
NM_001205321
NM_009134
RefSeq (білок)
NP_001280235
NP_001280236
NP_006505
NP_001192250
NP_033160
Локус (UCSC) Хр. 3: 38.7 – 38.82 Mb Хр. 9: 119.44 – 119.55 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SCN10A (англ. Sodium voltage-gated channel alpha subunit 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 956 амінокислот, а молекулярна маса — 220 626[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEFPIGSLET NNFRRFTPES LVEIEKQIAA KQGTKKAREK HREQKDQEEK
PRPQLDLKAC NQLPKFYGEL PAELIGEPLE DLDPFYSTHR TFMVLNKGRT
ISRFSATRAL WLFSPFNLIR RTAIKVSVHS WFSLFITVTI LVNCVCMTRT
DLPEKIEYVF TVIYTFEALI KILARGFCLN EFTYLRDPWN WLDFSVITLA
YVGTAIDLRG ISGLRTFRVL RALKTVSVIP GLKVIVGALI HSVKKLADVT
ILTIFCLSVF ALVGLQLFKG NLKNKCVKND MAVNETTNYS SHRKPDIYIN
KRGTSDPLLC GNGSDSGHCP DGYICLKTSD NPDFNYTSFD SFAWAFLSLF
RLMTQDSWER LYQQTLRTSG KIYMIFFVLV IFLGSFYLVN LILAVVTMAY
EEQNQATTDE IEAKEKKFQE ALEMLRKEQE VLAALGIDTT SLHSHNGSPL
TSKNASERRH RIKPRVSEGS TEDNKSPRSD PYNQRRMSFL GLASGKRRAS
HGSVFHFRSP GRDISLPEGV TDDGVFPGDH ESHRGSLLLG GGAGQQGPLP
RSPLPQPSNP DSRHGEDEHQ PPPTSELAPG AVDVSAFDAG QKKTFLSAEY
LDEPFRAQRA MSVVSIITSV LEELEESEQK CPPCLTSLSQ KYLIWDCCPM
WVKLKTILFG LVTDPFAELT ITLCIVVNTI FMAMEHHGMS PTFEAMLQIG
NIVFTIFFTA EMVFKIIAFD PYYYFQKKWN IFDCIIVTVS LLELGVAKKG
SLSVLRSFRL LRVFKLAKSW PTLNTLIKII GNSVGALGNL TIILAIIVFV
FALVGKQLLG ENYRNNRKNI SAPHEDWPRW HMHDFFHSFL IVFRILCGEW
IENMWACMEV GQKSICLILF LTVMVLGNLV VLNLFIALLL NSFSADNLTA
PEDDGEVNNL QVALARIQVF GHRTKQALCS FFSRSCPFPQ PKAEPELVVK
LPLSSSKAEN HIAANTARGS SGGLQAPRGP RDEHSDFIAN PTVWVSVPIA
EGESDLDDLE DDGGEDAQSF QQEVIPKGQQ EQLQQVERCG DHLTPRSPGT
GTSSEDLAPS LGETWKDESV PQVPAEGVDD TSSSEGSTVD CLDPEEILRK
IPELADDLEE PDDCFTEGCI RHCPCCKLDT TKSPWDVGWQ VRKTCYRIVE
HSWFESFIIF MILLSSGSLA FEDYYLDQKP TVKALLEYTD RVFTFIFVFE
MLLKWVAYGF KKYFTNAWCW LDFLIVNISL ISLTAKILEY SEVAPIKALR
TLRALRPLRA LSRFEGMRVV VDALVGAIPS IMNVLLVCLI FWLIFSIMGV
NLFAGKFWRC INYTDGEFSL VPLSIVNNKS DCKIQNSTGS FFWVNVKVNF
DNVAMGYLAL LQVATFKGWM DIMYAAVDSR EVNMQPKWED NVYMYLYFVI
FIIFGGFFTL NLFVGVIIDN FNQQKKKLGG QDIFMTEEQK KYYNAMKKLG
SKKPQKPIPR PLNKFQGFVF DIVTRQAFDI TIMVLICLNM ITMMVETDDQ
SEEKTKILGK INQFFVAVFT GECVMKMFAL RQYYFTNGWN VFDFIVVVLS
IASLIFSAIL KSLQSYFSPT LFRVIRLARI GRILRLIRAA KGIRTLLFAL
MMSLPALFNI GLLLFLVMFI YSIFGMSSFP HVRWEAGIDD MFNFQTFANS
MLCLFQITTS AGWDGLLSPI LNTGPPYCDP NLPNSNGTRG DCGSPAVGII
FFTTYIIISF LIMVNMYIAV ILENFNVATE ESTEPLSEDD FDMFYETWEK
FDPEATQFIT FSALSDFADT LSGPLRIPKP NRNILIQMDL PLVPGDKIHC
LDILFAFTKN VLGESGELDS LKANMEEKFM ATNLSKSSYE PIATTLRWKQ
EDISATVIQK AYRSYVLHRS MALSNTPCVP RAEEEAASLP DEGFVAFTAN
ENCVLPDKSE TASATSFPPS YESVTRGLSD RVNMRTSSSI QNEDEATSME
LIAPGP

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт натрію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з SCN10A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Sodium voltage-gated channel alpha subunit 10 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10582 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. UniProt, Q9Y5Y9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також