VDAC1

VDAC1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JK4, 2K4T
Ідентифікатори
Символи	VDAC1, PORIN, VDAC-1, voltage dependent anion channel 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604492 MGI: 106919 HomoloGene: 107244 GeneCards: VDAC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• porin activity; • transmembrane transporter binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • anion channel activity; • voltage-gated anion channel activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein kinase binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • Синаптичні бульбашки; • myelin sheath; • клітинна мембрана; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • мітохондрія; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • membrane raft; • mitochondrial nucleoid; • екзосома; • pore complex; • клітинне ядро; • mitochondrial permeability transition pore complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• chemical synaptic transmission; • epithelial cell differentiation; • mitochondrial calcium ion transmembrane transport; • neuron-neuron synaptic transmission; • ion transport; • навчення; • anion transport; • behavioral fear response; • anion transmembrane transport; • regulation of autophagy of mitochondrion; • трансмембранний транспорт; • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process; • GO:0022415 viral process; • macroautophagy; • GO:0097285 апоптоз; • regulation of anion transmembrane transport; • GO:0015915 транспорт; • pyruvate metabolic process; • inorganic anion transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7416
	22333
	ENSG00000213585
	ENSMUSG00000020402
	P21796
	Q60932
	NM_003374
	NM_011694; NM_001362693
	NP_003365
NP_035824; NP_001349622; NP_001387915; NP_001387916; NP_001387917;
	NP_001387918
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VDAC1 (англ. Voltage dependent anion channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот, а молекулярна маса — 30 773^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVPPTYADL	GKSARDVFTK	GYGFGLIKLD	LKTKSENGLE	FTSSGSANTE
TTKVTGSLET	KYRWTEYGLT	FTEKWNTDNT	LGTEITVEDQ	LARGLKLTFD
SSFSPNTGKK	NAKIKTGYKR	EHINLGCDMD	FDIAGPSIRG	ALVLGYEGWL
AGYQMNFETA	KSRVTQSNFA	VGYKTDEFQL	HTNVNDGTEF	GGSIYQKVNK
KLETAVNLAW	TAGNSNTRFG	IAAKYQIDPD	ACFSAKVNNS	SLIGLGYTQT
LKPGIKLTLS	ALLDGKNVNA	GGHKLGLGLE	FQA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до поринів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

Decker W.K., Bowles K.R., Schatte E.C., Towbin J.A., Craigen W.J. (1999). Revised fine mapping of the human voltage-dependent anion channel loci by radiation hybrid analysis. Mamm. Genome. 10: 1041—1042. PMID 10501981 doi:10.1007/s003359901158
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Thomas L., Blachly-Dyson E., Colombini M., Forte M.A. (1993). Mapping of residues forming the voltage sensor of the voltage-dependent anion-selective channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5446—5449. PMID 7685903 doi:10.1073/pnas.90.12.5446
Yu W.H., Wolfgang W., Forte M.A. (1995). Subcellular localization of human voltage-dependent anion channel isoforms. J. Biol. Chem. 270: 13998—14006. PMID 7539795 doi:10.1074/jbc.270.23.13998
Verrier F., Mignotte B., Jan G., Brenner C. (2003). Study of PTPC composition during apoptosis for identification of viral protein target. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1010: 126—142. PMID 15033708 doi:10.1196/annals.1299.022
Zamarin D., Garcia-Sastre A., Xiao X., Wang R., Palese P. (2005). Influenza virus PB1-F2 protein induces cell death through mitochondrial ANT3 and VDAC1. PLoS Pathog. 1: 40—54. PMID 16201016 doi:10.1371/journal.ppat.0010004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12669 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P21796 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 5

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12669 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P21796 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]