ARHGAP35

ARHGAP35
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2K85, 3C5H, 3FK2
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP35, GRF-1, GRLF1, P190-A, P190A, p190ARhoGAP, p190RhoGAP, Rho GTPase activating protein 35
Зовнішні ІД	OMIM: 605277 MGI: 1929494 HomoloGene: 35136 GeneCards: ARHGAP35
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GTP binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • phospholipid binding; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • GO:0006184 GTPase activity; • nucleotide binding; • lipid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • actin cytoskeleton; • клітинне ядро; • цитоскелет; • cell projection; • клітинна мембрана; • мембрана; • ciliary basal body;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of Rho protein signal transduction; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • neural tube closure; • regulation of cell shape; • forebrain development; • camera-type eye development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of small GTPase mediated signal transduction; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • negative regulation of vascular permeability; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • axon guidance; • axonal fasciculation; • regulation of actin polymerization or depolymerization; • positive regulation of neuron projection development; • cell migration; • central nervous system neuron axonogenesis; • mammary gland development; • establishment or maintenance of actin cytoskeleton polarity; • cellular response to extracellular stimulus; • regulation of actin cytoskeleton organization; • wound healing, spreading of cells; • positive regulation of cilium assembly; • regulation of axonogenesis; • neuron projection guidance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2909
	232906
	ENSG00000160007
	ENSMUSG00000058230
	Q9NRY4
	Q91YM2
	NM_004491; NM_024342
	NM_172739
	NP_004482
	NP_766327
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARHGAP35 (англ. Rho GTPase activating protein 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 499 амінокислот, а молекулярна маса — 170 514^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMMARKQDVR	IPTYNISVVG	LSGTEKEKGQ	CGIGKSCLCN	RFVRPSADEF
HLDHTSVLST	SDFGGRVVNN	DHFLYWGEVS	RSLEDCVECK	MHIVEQTEFI
DDQTFQPHRS	TALQPYIKRA	AATKLASAEK	LMYFCTDQLG	LEQDFEQKQM
PDGKLLVDGF	LLGIDVSRGM	NRNFDDQLKF	VSNLYNQLAK	TKKPIVVVLT
KCDEGVERYI	RDAHTFALSK	KNLQVVETSA	RSNVNVDLAF	STLVQLIDKS
RGKTKIIPYF	EALKQQSQQI	ATAKDKYEWL	VSRIVKNHNE	NWLSVSRKMQ
ASPEYQDYVY	LEGTQKAKKL	FLQHIHRLKH	EHIERRRKLY	LAALPLAFEA
LIPNLDEIDH	LSCIKAKKLL	ETKPEFLKWF	VVLEETPWDA	TSHIDNMENE
RIPFDLMDTV	PAEQLYEAHL	EKLRNERKRV	EMRRAFKENL	ETSPFITPGK
PWEEARSFIM	NEDFYQWLEE	SVYMDIYGKH	QKQIIDKAKE	EFQELLLEYS
ELFYELELDA	KPSKEKMGVI	QDVLGEEQRF	KALQKLQAER	DALILKHIHF
VYHPTKETCP	SCPACVDAKI	EHLISSRFIR	PSDRNQKNSL	SDPNIDRINL
VILGKDGLAR	ELANEIRALC	TNDDKYVIDG	KMYELSLRPI	EGNVRLPVNS
FQTPTFQPHG	CLCLYNSKES	LSYVVESIEK	SRESTLGRRD	NHLVHLPLTL
ILVNKRGDTS	GETLHSLIQQ	GQQIASKLQC	VFLDPASAGI	GYGRNINEKQ
ISQVLKGLLD	SKRNLNLVSS	TASIKDLADV	DLRIVMCLMC	GDPFSADDIL
FPVLQSQTCK	SSHCGSNNSV	LLELPIGLHK	KRIELSVLSY	HSSFSIRKSR
LVHGYIVFYS	AKRKASLAML	RAFLCEVQDI	IPIQLVALTD	GAVDVLDNDL
SREQLTEGEE	IAQEIDGRFT	SIPCSQPQHK	LEIFHPFFKD	VVEKKNIIEA
THMYDNAAEA	CSTTEEVFNS	PRAGSPLCNS	NLQDSEEDIE	PSYSLFREDT
SLPSLSKDHS	KLSMELEGND	GLSFIMSNFE	SKLNNKVPPP	VKPKPPVHFE
ITKGDLSYLD	QGHRDGQRKS	VSSSPWLPQD	GFDPSDYAEP	MDAVVKPRNE
EENIYSVPHD	STQGKIITIR	NINKAQSNGS	GNGSDSEMDT	SSLERGRKVS
IVSKPVLYRT	RCTRLGRFAS	YRTSFSVGSD	DELGPIRKKE	EDQASQGYKG
DNAVIPYETD	EDPRRRNILR	SLRRNTKKPK	PKPRPSITKA	TWESNYFGVP
LTTVVTPEKP	IPIFIERCIE	YIEATGLSTE	GIYRVSGNKS	EMESLQRQFD
QDHNLDLAEK	DFTVNTVAGA	MKSFFSELPD	PLVPYNMQID	LVEAHKINDR
EQKLHALKEV	LKKFPKENHE	VFKYVISHLN	KVSHNNKVNL	MTSENLSICF
WPTLMRPDFS	TMDALTATRT	YQTIIELFIQ	QCPFFFYNRP	ITEPPGARPS
SPSAVASTVP	FLTSTPVTSQ	PSPPQSPPPT	PQSPMQPLLP	SQLQAEHTL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Levay M., Settleman J., Ligeti E. (2009). Regulation of the substrate preference of p190RhoGAP by protein kinase C-mediated phosphorylation of a phospholipid binding site. Biochemistry. 48: 8615—8623. PMID 19673492 doi:10.1021/bi900667y
Bonet R., Ruiz L., Aragon E., Martin-Malpartida P., Macias M.J. (2009). NMR structural studies on human p190-A RhoGAPFF1 revealed that domain phosphorylation by the PDGF-receptor alpha requires its previous unfolding. J. Mol. Biol. 389: 230—237. PMID 19393245 doi:10.1016/j.jmb.2009.04.035
LeClerc S., Palaniswami R., Xie B.X., Govindan M.V. (1991). Molecular cloning and characterization of a factor that binds the human glucocorticoid receptor gene and represses its expression. J. Biol. Chem. 266: 17333—17340. PMID 1894621

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4591 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9NRY4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4591 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9NRY4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]