| RFX3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| RFX3, regulatory factor X3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601337 MGI: 106582 HomoloGene: 7917 GeneCards: RFX3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • клітинне ядро • extracellular region
|
|---|
| Біологічний процес |
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of type B pancreatic cell development • regulation of insulin secretion • epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry • cell maturation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • type B pancreatic cell maturation • determination of left/right symmetry • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cilium-dependent cell motility • endocrine pancreas development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • type B pancreatic cell differentiation • cilium assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 9: 3.22 – 3.53 Mb
| Хр. 19: 27.74 – 27.99 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
RFX3 (англ. Regulatory factor X3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 749 амінокислот, а молекулярна маса — 83 530[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQTSETGSDT
|
|
GSTVTLQTSV
|
|
ASQAAVPTQV
|
|
VQQVPVQQQV
|
|
QQVQTVQQVQ
|
| HVYPAQVQYV
|
|
EGSDTVYTNG
|
|
AIRTTTYPYT
|
|
ETQMYSQNTG
|
|
GNYFDTQGSS
|
| AQVTTVVSSH
|
|
SMVGTGGIQM
|
|
GVTGGQLISS
|
|
SGGTYLIGNS
|
|
MENSGHSVTH
|
| TTRASPATIE
|
|
MAIETLQKSD
|
|
GLSTHRSSLL
|
|
NSHLQWLLDN
|
|
YETAEGVSLP
|
| RSTLYNHYLR
|
|
HCQEHKLDPV
|
|
NAASFGKLIR
|
|
SIFMGLRTRR
|
|
LGTRGNSKYH
|
| YYGIRVKPDS
|
|
PLNRLQEDMQ
|
|
YMAMRQQPMQ
|
|
QKQRYKPMQK
|
|
VDGVADGFTG
|
| SGQQTGTSVE
|
|
QTVIAQSQHH
|
|
QQFLDASRAL
|
|
PEFGEVEISS
|
|
LPDGTTFEDI
|
| KSLQSLYREH
|
|
CEAILDVVVN
|
|
LQFSLIEKLW
|
|
QTFWRYSPST
|
|
PTDGTTITES
|
| SNLSEIESRL
|
|
PKAKLITLCK
|
|
HESILKWMCN
|
|
CDHGMYQALV
|
|
EILIPDVLRP
|
| IPSALTQAIR
|
|
NFAKSLEGWL
|
|
SNAMNNIPQR
|
|
MIQTKVAAVS
|
|
AFAQTLRRYT
|
| SLNHLAQAAR
|
|
AVLQNTSQIN
|
|
QMLSDLNRVD
|
|
FANVQEQASW
|
|
VCQCDDNMVQ
|
| RLETDFKMTL
|
|
QQQSTLEQWA
|
|
AWLDNVMMQA
|
|
LKPYEGRPSF
|
|
PKAARQFLLK
|
| WSFYSSMVIR
|
|
DLTLRSAASF
|
|
GSFHLIRLLY
|
|
DEYMFYLVEH
|
|
RVAQATGETP
|
| IAVMGEFGDL
|
|
NAVSPGNLDK
|
|
DEGSEVESEM
|
|
DEELDDSSEP
|
|
QAKREKTELS
|
| QAFPVGCMQP
|
|
VLETGVQPSL
|
|
LNPIHSEHIV
|
|
TSTQTIRQCS
|
|
ATGNTYTAV
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|