| LYL1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| LYL1, bHLHa18, lymphoblastic leukemia associated hematopoiesis regulator 1, basic helix-loop-helix family member, LYL1 basic helix-loop-helix family member |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 151440 MGI: 96891 HomoloGene: 4078 GeneCards: LYL1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • B cell differentiation • definitive hemopoiesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • blood vessel maturation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 13.1 – 13.1 Mb
| Хр. 8: 85.43 – 85.43 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
LYL1 (англ. LYL1, basic helix-loop-helix family member) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 280 амінокислот, а молекулярна маса — 29 938[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MCPPQAQAEV
|
|
GPTMTEKAEM
|
|
VCAPSPAPAP
|
|
PPKPASPGPP
|
|
QVEEVGHRGG
|
| SSPPRLPPGV
|
|
PVISLGHSRP
|
|
PGVAMPTTEL
|
|
GTLRPPLLQL
|
|
STLGTAPPTL
|
| ALHYHPHPFL
|
|
NSVYIGPAGP
|
|
FSIFPSSRLK
|
|
RRPSHCELDL
|
|
AEGHQPQKVA
|
| RRVFTNSRER
|
|
WRQQNVNGAF
|
|
AELRKLLPTH
|
|
PPDRKLSKNE
|
|
VLRLAMKYIG
|
| FLVRLLRDQA
|
|
AALAAGPTPP
|
|
GPRKRPVHRV
|
|
PDDGARRGSG
|
|
RRAEAAARSQ
|
| PAPPADPDGS
|
|
PGGAARPIKM
|
|
EQTALSPEVR
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Mellentin J.D., Smith S.D., Cleary M.L. (1989). lyl-1, a novel gene altered by chromosomal translocation in T cell leukemia, codes for a protein with a helix-loop-helix DNA binding motif. Cell. 58: 77—83. PMID 2752424 doi:10.1016/0092-8674(89)90404-2
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|