| ELK3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ELK3, ERP, NET, SAP2, SAP-2, ETS transcription factor, ETS transcription factor ELK3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600247 MGI: 101762 HomoloGene: 3833 GeneCards: ELK3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • purine-rich negative regulatory element binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• мітохондрія • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• transcription, DNA-templated • диференціація клітин • Загоєння ран • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Ангіогенез • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 12: 96.19 – 96.27 Mb
| Хр. 10: 93.08 – 93.15 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
ELK3 (англ. ELK3, ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 44 240[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MESAITLWQF
|
|
LLQLLLDQKH
|
|
EHLICWTSND
|
|
GEFKLLKAEE
|
|
VAKLWGLRKN
|
| KTNMNYDKLS
|
|
RALRYYYDKN
|
|
IIKKVIGQKF
|
|
VYKFVSFPEI
|
|
LKMDPHAVEI
|
| SRESLLLQDS
|
|
DCKASPEGRE
|
|
AHKHGLAALR
|
|
STSRNEYIHS
|
|
GLYSSFTINS
|
| LQNPPDAFKA
|
|
IKTEKLEEPP
|
|
EDSPPVEEVR
|
|
TVIRFVTNKT
|
|
DKHVTRPVVS
|
| LPSTSEAAAA
|
|
SAFLASSVSA
|
|
KISSLMLPNA
|
|
ASISSASPFS
|
|
SRSPSLSPNS
|
| PLPSEHRSLF
|
|
LEAACHDSDS
|
|
LEPLNLSSGS
|
|
KTKSPSLPPK
|
|
AKKPKGLEIS
|
| APPLVLSGTD
|
|
IGSIALNSPA
|
|
LPSGSLTPAF
|
|
FTAQTPNGLL
|
|
LTPSPLLSSI
|
| HFWSSLSPVA
|
|
PLSPARLQGP
|
|
STLFQFPTLL
|
|
NGHMPVPIPS
|
|
LDRAASPVLL
|
| SSNSQKS
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Giovane A., Pintzas A., Maira S.-M., Sobieszczuk P., Wasylyk B. (1994). Net, a new ets transcription factor that is activated by Ras. Genes Dev. 8: 1502—1513. PMID 7958835 doi:10.1101/gad.8.13.1502
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Price M.A., Rogers A.E., Treisman R. (1995). Comparative analysis of the ternary complex factors Elk-1, SAP-1a and SAP-2 (ERP/NET). EMBO J. 14: 2589—2601. PMID 7540136
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|