| FOXF1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| FOXF1, ACDMPV, FKHL5, FREAC1, forkhead box F1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601089 MGI: 1347470 HomoloGene: 1114 GeneCards: FOXF1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| alveolar capillary dysplasia[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• transcription regulator complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• somitogenesis • regulation of smooth muscle cell differentiation • renal system development • ureter development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung morphogenesis • embryonic foregut morphogenesis • lung development • positive regulation of cell migration • endocardial cushion development • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • extracellular matrix organization • cardiac left ventricle morphogenesis • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mast cell degranulation • smooth muscle cell differentiation • morphogenesis of a branching structure • venous blood vessel development • cellular response to cytokine stimulus • right lung morphogenesis • transcription, DNA-templated • васкулогенез • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • respiratory tube development • development of the heart • determination of left/right symmetry • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • blood vessel development • embryonic ectodermal digestive tract morphogenesis • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • embryonic digestive tract morphogenesis • animal organ morphogenesis • pancreas development • detection of wounding • mesenchyme migration • smoothened signaling pathway • lateral mesodermal cell differentiation • lung alveolus development • digestive tract development • lung vasculature development • mesoderm development • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • negative regulation of inflammatory response • lung lobe morphogenesis • ductus arteriosus closure • embryonic digestive tract development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development • midgut development • positive regulation of cell-substrate adhesion • transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • cell-cell adhesion • trachea development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 16: 86.51 – 86.52 Mb
| Хр. 8: 121.81 – 121.81 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
FOXF1 (англ. Forkhead box F1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 40 122[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSSAPEKQQP
|
|
PHGGGGGGGG
|
|
GGGAAMDPAS
|
|
SGPSKAKKTN
|
|
AGIRRPEKPP
|
| YSYIALIVMA
|
|
IQSSPTKRLT
|
|
LSEIYQFLQS
|
|
RFPFFRGSYQ
|
|
GWKNSVRHNL
|
| SLNECFIKLP
|
|
KGLGRPGKGH
|
|
YWTIDPASEF
|
|
MFEEGSFRRR
|
|
PRGFRRKCQA
|
| LKPMYSMMNG
|
|
LGFNHLPDTY
|
|
GFQGSAGGLS
|
|
CPPNSLALEG
|
|
GLGMMNGHLP
|
| GNVDGMALPS
|
|
HSVPHLPSNG
|
|
GHSYMGGCGG
|
|
AAAGEYPHHD
|
|
SSVPASPLLP
|
| TGAGGVMEPH
|
|
AVYSGSAAAW
|
|
PPSASAALNS
|
|
GASYIKQQPL
|
|
SPCNPAANPL
|
| SGSLSTHSLE
|
|
QPYLHQNSHN
|
|
APAELQGIPR
|
|
YHSQSPSMCD
|
|
RKEFVFSFNA
|
| MASSSMHSAG
|
|
GGSYYHQQVT
|
|
YQDIKPCVM
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Hellqvist M., Mahlapuu M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1996). Differential activation of lung-specific genes by two forkhead proteins, FREAC-1 and FREAC-2. J. Biol. Chem. 271: 4482—4490. PMID 8626802 doi:10.1074/jbc.271.8.4482
- Mahlapuu M., Pelto-Huikko M., Aitola M., Enerbaeck S., Carlsson P. (1998). FREAC-1 contains a cell-type-specific transcriptional activation domain and is expressed in epithelial-mesenchymal interfaces. Dev. Biol. 202: 183—195. PMID 9769171 doi:10.1006/dbio.1998.9010
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|