| HOXD13
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| HOXD13, BDE, BDSD, HOX4I, SPD, SPD1, homeobox D13 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 142989 MGI: 96205 HomoloGene: 20147 GeneCards: HOXD13
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| brachydactyly-syndactyly syndrome, brachydactyly type E1, VACTERL association, синдактилія[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific double-stranded DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• pattern specification process • skeletal system development • regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis • розвиток чоловічих статевих органів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • limb morphogenesis • embryonic digit morphogenesis • embryonic hindgut morphogenesis • branch elongation of an epithelium • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • gland morphogenesis • regulation of cell population proliferation • embryonic limb morphogenesis • prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis • anterior/posterior pattern specification • morphogenesis of an epithelial fold • transcription by RNA polymerase II • prostate gland development • response to testosterone • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 176.09 – 176.1 Mb
| Хр. 2: 74.5 – 74.5 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
HOXD13 (англ. Homeobox D13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот, а молекулярна маса — 36 101[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSRAGSWDMD
|
|
GLRADGGGAG
|
|
GAPASSSSSS
|
|
VAAAAASGQC
|
|
RGFLSAPVFA
|
| GTHSGRAAAA
|
|
AAAAAAAAAA
|
|
ASGFAYPGTS
|
|
ERTGSSSSSS
|
|
SSAVVAARPE
|
| APPAKECPAP
|
|
TPAAAAAAPP
|
|
SAPALGYGYH
|
|
FGNGYYSCRM
|
|
SHGVGLQQNA
|
| LKSSPHASLG
|
|
GFPVEKYMDV
|
|
SGLASSSVPA
|
|
NEVPARAKEV
|
|
SFYQGYTSPY
|
| QHVPGYIDMV
|
|
STFGSGEPRH
|
|
EAYISMEGYQ
|
|
SWTLANGWNS
|
|
QVYCTKDQPQ
|
| GSHFWKSSFP
|
|
GDVALNQPDM
|
|
CVYRRGRKKR
|
|
VPYTKLQLKE
|
|
LENEYAINKF
|
| INKDKRRRIS
|
|
AATNLSERQV
|
|
TIWFQNRRVK
|
|
DKKIVSKLKD
|
|
TVS
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|