| NR5A1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| NR5A1, AD4BP, ELP, FTZ1, FTZF1, POF7, SF-1, SF1, SPGF8, SRXY3, hSF-1, nuclear receptor subfamily 5 group A member 1, SRXX4 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 184757 MGI: 1346833 HomoloGene: 3638 GeneCards: NR5A1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| передчасне виснаження яєчників, male infertility with azoospermia or oligozoospermia due to single gene mutation[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • lipid binding • зв’язування дволанцюгових ДНК • enzyme binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • phospholipid binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • regulation of steroid biosynthetic process • hormone metabolic process • luteinization • розмножувальний процес • primary sex determination • гістогенез • multicellular organism aging • диференціація клітин • maintenance of protein location in nucleus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • adrenal gland development • transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • cell-cell signaling • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of female gonad development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of male gonad development • intracellular receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Детермінація статі • male gonad development • female gonad development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • hormone-mediated signaling pathway • calcineurin-mediated signaling • response to gonadotropin-releasing hormone • male sex determination
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 9: 124.48 – 124.51 Mb
| Хр. 2: 38.58 – 38.6 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
NR5A1 (англ. Nuclear receptor subfamily 5 group A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 51 636[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDYSYDEDLD
|
|
ELCPVCGDKV
|
|
SGYHYGLLTC
|
|
ESCKGFFKRT
|
|
VQNNKHYTCT
|
| ESQSCKIDKT
|
|
QRKRCPFCRF
|
|
QKCLTVGMRL
|
|
EAVRADRMRG
|
|
GRNKFGPMYK
|
| RDRALKQQKK
|
|
AQIRANGFKL
|
|
ETGPPMGVPP
|
|
PPPPAPDYVL
|
|
PPSLHGPEPK
|
| GLAAGPPAGP
|
|
LGDFGAPALP
|
|
MAVPGAHGPL
|
|
AGYLYPAFPG
|
|
RAIKSEYPEP
|
| YASPPQPGLP
|
|
YGYPEPFSGG
|
|
PNVPELILQL
|
|
LQLEPDEDQV
|
|
RARILGCLQE
|
| PTKSRPDQPA
|
|
AFGLLCRMAD
|
|
QTFISIVDWA
|
|
RRCMVFKELE
|
|
VADQMTLLQN
|
| CWSELLVFDH
|
|
IYRQVQHGKE
|
|
GSILLVTGQE
|
|
VELTTVATQA
|
|
GSLLHSLVLR
|
| AQELVLQLLA
|
|
LQLDRQEFVC
|
|
LKFIILFSLD
|
|
LKFLNNHILV
|
|
KDAQEKANAA
|
| LLDYTLCHYP
|
|
HCGDKFQQLL
|
|
LCLVEVRALS
|
|
MQAKEYLYHK
|
|
HLGNEMPRNN
|
| LLIEMLQAKQ
|
|
T
|
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання.
Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Wong M., Ramayya M.S., Chrousos G.P., Driggers P.H., Parker K.L. (1996). Cloning and sequence analysis of the human gene encoding steroidogenic factor 1. J. Mol. Endocrinol. 17: 139—147. PMID 8938589 doi:10.1677/jme.0.0170139
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Jacob A.L., Lund J., Martinez P., Hedin L. (2001). Acetylation of steroidogenic factor 1 protein regulates its transcriptional activity and recruits the coactivator GCN5. J. Biol. Chem. 276: 37659—37664. PMID 11479297 doi:10.1074/jbc.M104427200
- Lan H.-C., Li H.-J., Lin G., Lai P.-Y., Chung B.-C. (2007). Cyclic AMP stimulates SF-1-dependent CYP11A1 expression through homeodomain-interacting protein kinase 3-mediated Jun N-terminal kinase and c-Jun phosphorylation. Mol. Cell. Biol. 27: 2027—2036. PMID 17210646 doi:10.1128/MCB.02253-06
- Achermann J.C., Ito M., Ito M., Hindmarsh P.C., Jameson J.L. (1999). A mutation in the gene encoding steroidogenic factor-1 causes XY sex reversal and adrenal failure in humans. Nat. Genet. 22: 125—126. PMID 10369247 doi:10.1038/9629
- Biason-Lauber A., Schoenle E.J. (2000). Apparently normal ovarian differentiation in a prepubertal girl with transcriptionally inactive steroidogenic factor 1 (NR5A1/SF-1) and adrenocortical insufficiency. Am. J. Hum. Genet. 67: 1563—1568. PMID 11038323 doi:10.1086/316893
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|