| EMX2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| EMX2, empty spiracles homeobox 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 600035 MGI: 95388 HomoloGene: 3023 GeneCards: EMX2
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| schizencephaly[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• cerebral cortex development • multicellular organism development • регуляція експресії генів • renal system development • forebrain development • brain development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell proliferation in forebrain • forebrain cell migration • cerebral cortex regionalization • neuron differentiation • anterior/posterior pattern specification • dentate gyrus development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • ureter morphogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
н/д
| Хр. 19: 59.45 – 59.45 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
EMX2 (англ. Empty spiracles homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 252 амінокислот, а молекулярна маса — 28 303[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MFQPAPKRCF
|
|
TIESLVAKDS
|
|
PLPASRSEDP
|
|
IRPAALSYAN
|
|
SSPINPFLNG
|
| FHSAAAAAAG
|
|
RGVYSNPDLV
|
|
FAEAVSHPPN
|
|
PAVPVHPVPP
|
|
PHALAAHPLP
|
| SSHSPHPLFA
|
|
SQQRDPSTFY
|
|
PWLIHRYRYL
|
|
GHRFQGNDTS
|
|
PESFLLHNAL
|
| ARKPKRIRTA
|
|
FSPSQLLRLE
|
|
HAFEKNHYVV
|
|
GAERKQLAHS
|
|
LSLTETQVKV
|
| WFQNRRTKFK
|
|
RQKLEEEGSD
|
|
SQQKKKGTHH
|
|
INRWRIATKQ
|
|
ASPEEIDVTS
|
| DD
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Noonan F.C., Mutch D.G., Mallon M., Goodfellow P.J. (2001). Characterization of the homeodomain gene EMX2: sequence conservation, expression analysis and a search for mutations in endometrial cancers. Genomics. 76: 37—44. PMID 11549315 doi:10.1006/geno.2001.6590
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|