| TOX
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| TOX, TOX1, thymocyte selection associated high mobility group box |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 606863 MGI: 2181659 HomoloGene: 8822 GeneCards: TOX
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• lymphocyte differentiation • positive regulation of natural killer cell differentiation • lymph node development • Peyer's patch development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 8: 58.81 – 59.12 Mb
| Хр. 4: 6.69 – 6.99 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
TOX (англ. Thymocyte selection associated high mobility group box) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 526 амінокислот, а молекулярна маса — 57 513[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MDVRFYPPPA
|
|
QPAAAPDAPC
|
|
LGPSPCLDPY
|
|
YCNKFDGENM
|
|
YMSMTEPSQD
|
| YVPASQSYPG
|
|
PSLESEDFNI
|
|
PPITPPSLPD
|
|
HSLVHLNEVE
|
|
SGYHSLCHPM
|
| NHNGLLPFHP
|
|
QNMDLPEITV
|
|
SNMLGQDGTL
|
|
LSNSISVMPD
|
|
IRNPEGTQYS
|
| SHPQMAAMRP
|
|
RGQPADIRQQ
|
|
PGMMPHGQLT
|
|
TINQSQLSAQ
|
|
LGLNMGGSNV
|
| PHNSPSPPGS
|
|
KSATPSPSSS
|
|
VHEDEGDDTS
|
|
KINGGEKRPA
|
|
SDMGKKPKTP
|
| KKKKKKDPNE
|
|
PQKPVSAYAL
|
|
FFRDTQAAIK
|
|
GQNPNATFGE
|
|
VSKIVASMWD
|
| GLGEEQKQVY
|
|
KKKTEAAKKE
|
|
YLKQLAAYRA
|
|
SLVSKSYSEP
|
|
VDVKTSQPPQ
|
| LINSKPSVFH
|
|
GPSQAHSALY
|
|
LSSHYHQQPG
|
|
MNPHLTAMHP
|
|
SLPRNIAPKP
|
| NNQMPVTVSI
|
|
ANMAVSPPPP
|
|
LQISPPLHQH
|
|
LNMQQHQPLT
|
|
MQQPLGNQLP
|
| MQVQSALHSP
|
|
TMQQGFTLQP
|
|
DYQTIINPTS
|
|
TAAQVVTQAM
|
|
EYVRSGCRNP
|
| PPQPVDWNND
|
|
YCSSGGMQRD
|
|
KALYLT
|
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|