ESRRB

ESRRB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1LO1
Ідентифікатори
Символи	ESRRB, DFNB35, ERR2, ERRb, ESRL2, NR3B2, estrogen related receptor beta, ERRbeta2, ERR beta-2, Esrrb
Зовнішні ІД	OMIM: 602167 MGI: 1346832 HomoloGene: 69108 GeneCards: ESRRB
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal recessive nonsyndromic deafness 35, nonsyndromic deafness
Реагує на сполуку
	biochanin A, Дайджеїн, Геністейн, діетилстільбестрол
Онтологія гена
Молекулярна функція	• steroid binding; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • zinc ion binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • зв’язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase II complex binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • condensed chromosome; • integrator complex; • хромосома; • цитоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • embryonic placenta development; • transcription, DNA-templated; • steroid hormone mediated signaling pathway; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • intracellular receptor signaling pathway; • stem cell population maintenance; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • проліферація; • stem cell division; • cell dedifferentiation; • photoreceptor cell maintenance; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • inner ear development; • positive regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle; • positive regulation of transcription involved in G2/M transition of mitotic cell cycle; • positive regulation of stem cell population maintenance; • regulation of stem cell division; • negative regulation of stem cell differentiation; • positive regulation of glycogen biosynthetic process; • positive regulation of glycolytic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2103
	26380
	ENSG00000119715
	ENSMUSG00000021255
	O95718
	Q61539
	NM_004452; NM_001379180
	NM_001159500; NM_011934
	NP_004443; NP_001366109
	NP_001152972; NP_036064
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ESRRB (англ. Estrogen related receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 48 054^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSDDRHLGS	SCGSFIKTEP	SSPSSGIDAL	SHHSPSGSSD	ASGGFGLALG
THANGLDSPP	MFAGAGLGGT	PCRKSYEDCA	SGIMEDSAIK	CEYMLNAIPK
RLCLVCGDIA	SGYHYGVASC	EACKAFFKRT	IQGNIEYSCP	ATNECEITKR
RRKSCQACRF	MKCLKVGMLK	EGVRLDRVRG	GRQKYKRRLD	SESSPYLSLQ
ISPPAKKPLT	KIVSYLLVAE	PDKLYAMPPP	GMPEGDIKAL	TTLCDLADRE
LVVIIGWAKH	IPGFSSLSLG	DQMSLLQSAW	MEILILGIVY	RSLPYDDKLV
YAEDYIMDEE	HSRLAGLLEL	YRAILQLVRR	YKKLKVEKEE	FVTLKALALA
NSDSMYIEDL	EAVQKLQDLL	HEALQDYELS	QRHEEPWRTG	KLLLTLPLLR
QTAAKAVQHF	YSVKLQGKVP	MHKLFLEMLE	AKV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Zhou W., Lo S.C., Liu J.H., Hannink M., Lubahn D.B. (2007). ERRbeta: a potent inhibitor of Nrf2 transcriptional activity. Mol. Cell. Endocrinol. 278: 52—62. PMID 17920186 doi:10.1016/j.mce.2007.08.011
Bombail V., Collins F., Brown P., Saunders P.T. (2010). Modulation of ER alpha transcriptional activity by the orphan nuclear receptor ERR beta and evidence for differential effects of long- and short-form splice variants. Mol. Cell. Endocrinol. 314: 53—61. PMID 19755138 doi:10.1016/j.mce.2009.09.007
Cho Y., Hazen B.C., Russell A.P., Kralli A. (2013). Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1 (PGC-1)- and estrogen-related receptor (ERR)-induced regulator in muscle 1 (Perm1) is a tissue-specific regulator of oxidative capacity in skeletal muscle cells. J. Biol. Chem. 288: 25207—25218. PMID 23836911 doi:10.1074/jbc.M113.489674
Bombail V., MacPherson S., Critchley H.O., Saunders P.T. (2008). Estrogen receptor related beta is expressed in human endometrium throughout the normal menstrual cycle. Hum. Reprod. 23: 2782—2790. PMID 18775884 doi:10.1093/humrep/den298
Wilson B.J., Tremblay A.M., Deblois G., Sylvain-Drolet G., Giguere V. (2010). An acetylation switch modulates the transcriptional activity of estrogen-related receptor alpha. Mol. Endocrinol. 24: 1349—1358. PMID 20484414 doi:10.1210/me.2009-0441

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ESRRB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Estrogen related receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3473 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O95718 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ESRRB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Estrogen related receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3473 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]

[UniProt-6] UniProt, O95718 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]