| ZNF649
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ZNF649, zinc finger protein 649 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 611903 HomoloGene: 56964 GeneCards: ZNF649
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро • міжклітинний простір • нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 51.89 – 51.91 Mb
| н/д
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| н/д |
|---|
| Вікідані |
|
ZNF649 (англ. Zinc finger protein 649) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот, а молекулярна маса — 57 683[3].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MTKAQESLTL
|
|
EDVAVDFTWE
|
|
EWQFLSPAQK
|
|
DLYRDVMLEN
|
|
YSNLVSVGYQ
|
| AGKPDALTKL
|
|
EQGEPLWTLE
|
|
DEIHSPAHPE
|
|
IEKADDHLQQ
|
|
PLQNQKILKR
|
| TGQRYEHGRT
|
|
LKSYLGLTNQ
|
|
SRRYNRKEPA
|
|
EFNGDGAFLH
|
|
DNHEQMPTEI
|
| EFPESRKPIS
|
|
TKSQFLKHQQ
|
|
THNIEKAHEC
|
|
TDCGKAFLKK
|
|
SQLTEHKRIH
|
| TGKKPHVCSL
|
|
CGKAFYKKYR
|
|
LTEHERAHRG
|
|
EKPHGCSLCG
|
|
KAFYKRYRLT
|
| EHERAHKGEK
|
|
PYGCSECGKA
|
|
FPRKSELTEH
|
|
QRIHTGIKPH
|
|
QCSECGRAFS
|
| RKSLLVVHQR
|
|
THTGEKPHTC
|
|
SECGKGFIQK
|
|
GNLNIHQRTH
|
|
TGEKPYGCID
|
| CGKAFSQKSC
|
|
LVAHQRYHTG
|
|
KTPFVCPECG
|
|
QPCSQKSGLI
|
|
RHQKIHSGEK
|
| PYKCSDCGKA
|
|
FLTKTMLIVH
|
|
HRTHTGERPY
|
|
GCDECEKAYF
|
|
YMSCLVKHKR
|
| IHSREKRGDS
|
|
VKVENPSTAS
|
|
HSLSPSEHVQ
|
|
GKSPVNMVTV
|
|
AMVAGQCEFA
|
| HILHS
|
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|