| PITX3
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| PITX3, ASMD, ASOD, CTPP4, CTRCT11, PTX3, paired like homeodomain 3, ASGD1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602669 MGI: 1100498 HomoloGene: 3689 GeneCards: PITX3
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| anterior segment mesenchymal dysgenesis, cataract 11 multiple types[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • soma
|
|---|
| Біологічний процес |
• animal organ morphogenesis • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • dopaminergic neuron differentiation • регуляція експресії генів • neuron development • lens development in camera-type eye • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lens fiber cell differentiation • lens morphogenesis in camera-type eye • transcription by RNA polymerase II • locomotory behavior • midbrain development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0010260 старіння людини • negative regulation of gliogenesis • response to immobilization stress • response to cocaine • response to morphine • positive regulation of neuron apoptotic process • negative regulation of neurogenesis • response to methamphetamine hydrochloride • positive regulation of cell proliferation in midbrain • cellular response to glial cell derived neurotrophic factor • anatomical structure morphogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
н/д
| Хр. 19: 46.12 – 46.14 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
PITX3 (англ. Paired like homeodomain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 302 амінокислот, а молекулярна маса — 31 832[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MEFGLLSEAE
|
|
ARSPALSLSD
|
|
AGTPHPQLPE
|
|
HGCKGQEHSD
|
|
SEKASASLPG
|
| GSPEDGSLKK
|
|
KQRRQRTHFT
|
|
SQQLQELEAT
|
|
FQRNRYPDMS
|
|
TREEIAVWTN
|
| LTEARVRVWF
|
|
KNRRAKWRKR
|
|
ERSQQAELCK
|
|
GSFAAPLGGL
|
|
VPPYEEVYPG
|
| YSYGNWPPKA
|
|
LAPPLAAKTF
|
|
PFAFNSVNVG
|
|
PLASQPVFSP
|
|
PSSIAASMVP
|
| SAAAAPGTVP
|
|
GPGALQGLGG
|
|
GPPGLAPAAV
|
|
SSGAVSCPYA
|
|
SAAAAAAAAA
|
| SSPYVYRDPC
|
|
NSSLASLRLK
|
|
AKQHASFSYP
|
|
AVHGPPPAAN
|
|
LSPCQYAVER
|
| PV
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|