| ATF3
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ATF3, activating transcription factor 3 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 603148 MGI: 109384 HomoloGene: 1265 GeneCards: ATF3
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein heterodimerization activity • identical protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• ядерце • нуклеоплазма • CHOP-ATF3 complex • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • positive regulation of cell population proliferation • skeletal muscle cell differentiation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance • глюконеогенез • cellular response to amino acid starvation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of TRAIL-activated apoptotic signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • PERK-mediated unfolded protein response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Відповідь на незгорнуті білки • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 212.57 – 212.62 Mb
| Хр. 1: 190.9 – 190.95 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
ATF3 (англ. Activating transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 181 амінокислот, а молекулярна маса — 20 576[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MMLQHPGQVS
|
|
ASEVSASAIV
|
|
PCLSPPGSLV
|
|
FEDFANLTPF
|
|
VKEELRFAIQ
|
| NKHLCHRMSS
|
|
ALESVTVSDR
|
|
PLGVSITKAE
|
|
VAPEEDERKK
|
|
RRRERNKIAA
|
| AKCRNKKKEK
|
|
TECLQKESEK
|
|
LESVNAELKA
|
|
QIEELKNEKQ
|
|
HLIYMLNLHR
|
| PTCIVRAQNG
|
|
RTPEDERNLF
|
|
IQQIKEGTLQ
|
|
S
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Pan Y., Chen H., Siu F., Kilberg M.S. (2003). Amino acid deprivation and endoplasmic reticulum stress induce expression of multiple activating transcription factor-3 mRNA species that, when overexpressed in HepG2 cells, modulate transcription by the human asparagine synthetase promoter. J. Biol. Chem. 278: 38402—38412. PMID 12881527 doi:10.1074/jbc.M304574200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 doi:10.1101/gad.3.12b.2083
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PMID 14759258 doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Chen B.P.C., Liang G., Whelan J., Hai T. (1994). ATF3 and ATF3 delta Zip. Transcriptional repression versus activation by alternatively spliced isoforms. J. Biol. Chem. 269: 15819—15826. PMID 7515060
- Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1990). Genes Dev. 4: 682—682.
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|