SMAD5

SMAD5
Ідентифікатори
Символи	SMAD5, DWFC, JV5-1, MADH5, SMAD family member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 603110 MGI: 1328787 HomoloGene: 4313 GeneCards: SMAD5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • DEAD/H-box RNA helicase binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• SMAD protein complex; • transcription regulator complex; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• germ cell development; • ureteric bud development; • cardiac muscle contraction; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • SMAD protein signal transduction; • embryonic pattern specification; • осифікація; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • cellular response to BMP stimulus; • BMP signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • Mullerian duct regression; • protein phosphorylation; • cartilage development; • positive regulation of osteoblast differentiation; • erythrocyte differentiation; • bone development; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • osteoblast fate commitment; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4090
	17129
	ENSG00000113658
	ENSMUSG00000021540
	Q99717
	P97454
	NM_005903; NM_001001419; NM_001001420
	NM_001164041; NM_001164042; NM_008541
	NP_001001419; NP_001001420; NP_005894
	NP_001157513; NP_001157514; NP_032567
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMAD5 (англ. SMAD family member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 258^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSMASLFSF	TSPAVKRLLG	WKQGDEEEKW	AEKAVDALVK	KLKKKKGAME
ELEKALSSPG	QPSKCVTIPR	SLDGRLQVSH	RKGLPHVIYC	RVWRWPDLQS
HHELKPLDIC	EFPFGSKQKE	VCINPYHYKR	VESPVLPPVL	VPRHNEFNPQ
HSLLVQFRNL	SHNEPHMPQN	ATFPDSFHQP	NNTPFPLSPN	SPYPPSPASS
TYPNSPASSG	PGSPFQLPAD	TPPPAYMPPD	DQMGQDNSQP	MDTSNNMIPQ
IMPSISSRDV	QPVAYEEPKH	WCSIVYYELN	NRVGEAFHAS	STSVLVDGFT
DPSNNKSRFC	LGLLSNVNRN	STIENTRRHI	GKGVHLYYVG	GEVYAECLSD
SSIFVQSRNC	NFHHGFHPTT	VCKIPSSCSL	KIFNNQEFAQ	LLAQSVNHGF
EAVYELTKMC	TIRMSFVKGW	GAEYHRQDVT	STPCWIEIHL	HGPLQWLDKV
LTQMGSPLNP	ISSVS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Zavadil J., Brezinova J., Svoboda P., Zemanova Z., Michalova K. (1997). Smad5, a tumor suppressor candidate at 5q31.1, is hemizygously lost and not mutated in the retained allele in human leukemia cell line HL60. Leukemia. 11: 1187—1192. PMID 9264367 doi:10.1038/sj.leu.2400750
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 doi:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 doi:10.1016/S1359-6101(99)00012-X
Wrana J.L., Attisano L. (2000). The Smad pathway. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 5—13. PMID 10708948 doi:10.1016/S1359-6101(99)00024-6
Miyazono K. (2000). TGF-beta signaling by Smad proteins. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 15—22. PMID 10708949 doi:10.1016/S1359-6101(99)00025-8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6771 (англ.) . Архів оригіналу за 21 січня 2016. Процитовано 31 серпня 2017. [Архівовано 2016-01-21 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q99717 (англ.) . Архів оригіналу за 18 липня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6771 (англ.) . Архів оригіналу за 21 січня 2016. Процитовано 31 серпня 2017. [Архівовано 2016-01-21 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q99717 (англ.) . Архів оригіналу за 18 липня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]