| OSR1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| OSR1, ODD, odd-skipped related transcription factor 1, odd-skipped related transciption factor 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 608891 MGI: 1344424 HomoloGene: 8035 GeneCards: OSR1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • гіалоплазма • extrinsic component of membrane
|
|---|
| Біологічний процес |
• pronephros development • cellular response to retinoic acid • metanephric glomerulus vasculature development • roof of mouth development • диференціація клітин • specification of posterior mesonephric tubule identity • ureteric bud development • specification of anterior mesonephric tubule identity • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chondrocyte differentiation • negative regulation of nephron tubule epithelial cell differentiation • positive regulation of gastrulation • embryonic skeletal joint development • metanephric cap mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development • positive regulation of bone mineralization • positive regulation of epithelial cell proliferation • embryonic skeletal limb joint morphogenesis • metanephric mesenchymal cell differentiation • posterior mesonephric tubule development • intermediate mesoderm development • embryonic digit morphogenesis • metanephric epithelium development • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • mesonephric duct morphogenesis • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • odontogenesis • mesonephros development • cell proliferation involved in kidney development • development of the heart • metanephric nephron tubule development • ureter urothelium development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • mesangial cell development • pattern specification involved in metanephros development • metanephric smooth muscle tissue development • renal vesicle progenitor cell differentiation • middle ear morphogenesis • embryonic skeletal joint morphogenesis • urogenital system development • metanephric mesenchyme morphogenesis • metanephros development • negative regulation of epithelial cell differentiation • metanephric interstitial fibroblast development • gonad development • embryonic forelimb morphogenesis • metanephric mesenchyme development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic hindlimb morphogenesis • osmosensory signaling pathway • peptidyl-threonine phosphorylation • negative regulation of creatine transmembrane transporter activity • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 19.35 – 19.36 Mb
| Хр. 12: 9.62 – 9.63 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
OSR1 (англ. Odd-skipped related transciption factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 29 611[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MGSKTLPAPV
|
|
PIHPSLQLTN
|
|
YSFLQAVNGL
|
|
PTVPSDHLPN
|
|
LYGFSALHAV
|
| HLHQWTLGYP
|
|
AMHLPRSSFS
|
|
KVPGTVSSLV
|
|
DARFQLPAFP
|
|
WFPHVIQPKP
|
| EITAGGSVPA
|
|
LKTKPRFDFA
|
|
NLALAATQED
|
|
PAKLGRGEGP
|
|
GSPAGGLGAL
|
| LDVTKLSPEK
|
|
KPTRGRLPSK
|
|
TKKEFVCKFC
|
|
GRHFTKSYNL
|
|
LIHERTHTDE
|
| RPYTCDICHK
|
|
AFRRQDHLRD
|
|
HRYIHSKEKP
|
|
FKCQECGKGF
|
|
CQSRTLAVHK
|
| TLHSQVKELK
|
|
TSKIKC
|
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Katoh M. (2002). Molecular cloning and characterization of OSR1 on human chromosome 2p24. Int. J. Mol. Med. 10: 221—225. PMID 12119563
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|