| RORB
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| RORB, NR1F2, ROR-BETA, RZR-BETA, RZRB, bA133M9.1, RAR-related orphan receptor beta, RAR related orphan receptor B, EIG15 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 601972 MGI: 1343464 HomoloGene: 38250 GeneCards: RORB
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| аметропія, generalized epilepsy[1] |
|
|
| Реагує на сполуку |
|---|
| третиноїн[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • transcription factor binding • зв’язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • melatonin receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• cellular response to retinoic acid • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • відповідь на стимул • ритмічний процес • retinal cone cell development • negative regulation of osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • multicellular organism development • regulation of circadian rhythm • retinal rod cell development • eye photoreceptor cell development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • зріння (видіннє) • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • amacrine cell differentiation • retina development in camera-type eye • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • G protein-coupled receptor signaling pathway • transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 9: 74.5 – 74.69 Mb
| Хр. 19: 18.91 – 19.09 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[3]
| [4] |
|---|
| Вікідані |
|
RORB (англ. Nuclear receptor ROR-beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 53 220[6].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MCENQLKTKA
|
|
DATAQIEVIP
|
|
CKICGDKSSG
|
|
IHYGVITCEG
|
|
CKGFFRRSQQ
|
| NNASYSCPRQ
|
|
RNCLIDRTNR
|
|
NRCQHCRLQK
|
|
CLALGMSRDA
|
|
VKFGRMSKKQ
|
| RDSLYAEVQK
|
|
HQQRLQEQRQ
|
|
QQSGEAEALA
|
|
RVYSSSISNG
|
|
LSNLNNETSG
|
| TYANGHVIDL
|
|
PKSEGYYNVD
|
|
SGQPSPDQSG
|
|
LDMTGIKQIK
|
|
QEPIYDLTSV
|
| PNLFTYSSFN
|
|
NGQLAPGITM
|
|
TEIDRIAQNI
|
|
IKSHLETCQY
|
|
TMEELHQLAW
|
| QTHTYEEIKA
|
|
YQSKSREALW
|
|
QQCAIQITHA
|
|
IQYVVEFAKR
|
|
ITGFMELCQN
|
| DQILLLKSGC
|
|
LEVVLVRMCR
|
|
AFNPLNNTVL
|
|
FEGKYGGMQM
|
|
FKALGSDDLV
|
| NEAFDFAKNL
|
|
CSLQLTEEEI
|
|
ALFSSAVLIS
|
|
PDRAWLIEPR
|
|
KVQKLQEKIY
|
| FALQHVIQKN
|
|
HLDDETLAKL
|
|
IAKIPTITAV
|
|
CNLHGEKLQV
|
|
FKQSHPEIVN
|
| TLFPPLYKEL
|
|
FNPDCATGCK
|
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|