| EGR1
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| EGR1, AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, early growth response 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 128990 MGI: 95295 HomoloGene: 56394 GeneCards: EGR1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • зв’язування з іоном металу • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • nucleic acid binding • hemi-methylated DNA-binding • double-stranded methylated DNA binding • zinc ion binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• regulation of apoptotic process • cellular response to organic substance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glomerular mesangial cell proliferation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to glucose • transcription by RNA polymerase II • BMP signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • response to insulin • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to mycophenolic acid • T cell differentiation • type I interferon signaling pathway • positive regulation of glomerular metanephric mesangial cell proliferation • cellular response to gamma radiation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • skeletal muscle cell differentiation • cellular response to heparin • regulation of protein sumoylation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to interleukin-8 • response to hypoxia • response to ischemia • еструс • positive regulation of hormone biosynthetic process • regulation of progesterone biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression • circadian regulation of gene expression • locomotor rhythm • ритмічний процес • circadian temperature homeostasis • positive regulation of neuron death • positive regulation of tau-protein kinase activity
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 5: 138.47 – 138.47 Mb
| Хр. 18: 34.99 – 35 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
EGR1 (англ. Early growth response 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 57 507[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAAAKAEMQL
|
|
MSPLQISDPF
|
|
GSFPHSPTMD
|
|
NYPKLEEMML
|
|
LSNGAPQFLG
|
| AAGAPEGSGS
|
|
NSSSSSSGGG
|
|
GGGGGGSNSS
|
|
SSSSTFNPQA
|
|
DTGEQPYEHL
|
| TAESFPDISL
|
|
NNEKVLVETS
|
|
YPSQTTRLPP
|
|
ITYTGRFSLE
|
|
PAPNSGNTLW
|
| PEPLFSLVSG
|
|
LVSMTNPPAS
|
|
SSSAPSPAAS
|
|
SASASQSPPL
|
|
SCAVPSNDSS
|
| PIYSAAPTFP
|
|
TPNTDIFPEP
|
|
QSQAFPGSAG
|
|
TALQYPPPAY
|
|
PAAKGGFQVP
|
| MIPDYLFPQQ
|
|
QGDLGLGTPD
|
|
QKPFQGLESR
|
|
TQQPSLTPLS
|
|
TIKAFATQSG
|
| SQDLKALNTS
|
|
YQSQLIKPSR
|
|
MRKYPNRPSK
|
|
TPPHERPYAC
|
|
PVESCDRRFS
|
| RSDELTRHIR
|
|
IHTGQKPFQC
|
|
RICMRNFSRS
|
|
DHLTTHIRTH
|
|
TGEKPFACDI
|
| CGRKFARSDE
|
|
RKRHTKIHLR
|
|
QKDKKADKSV
|
|
VASSATSSLS
|
|
SYPSPVATSY
|
| PSPVTTSYPS
|
|
PATTSYPSPV
|
|
PTSFSSPGSS
|
|
TYPSPVHSGF
|
|
PSPSVATTYS
|
| SVPPAFPAQV
|
|
SSFPSSAVTN
|
|
SFSASTGLSD
|
|
MTATFSPRTI
|
|
EIC
|
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Suggs S.V., Katzowitz J.L., Tsai-Morris C.-H., Sukhatme V.P. (1990). cDNA sequence of the human cellular early growth response gene Egr-1. Nucleic Acids Res. 18: 4283—4283. PMID 2377485 doi:10.1093/nar/18.14.4283
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Cullen E.M., Brazil J.C., O'Connor C.M. (2010). Mature human neutrophils constitutively express the transcription factor EGR-1. Mol. Immunol. 47: 1701—1709. PMID 20363028 doi:10.1016/j.molimm.2010.03.003
- Zandarashvili L., White M.A., Esadze A., Iwahara J. (2015). Structural impact of complete CpG methylation within target DNA on specific complex formation of the inducible transcription factor Egr-1. FEBS Lett. 589: 1748—1753. PMID 25999311 doi:10.1016/j.febslet.2015.05.022
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|