ZBTB7A

ZBTB7A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2IF5, 2NN2
Ідентифікатори
Символи	ZBTB7A, FBI-1, FBI1, LRF, ZBTB7, ZNF857A, pokemon, TIP21, zinc finger and BTB domain containing 7A, MNDLFH
Зовнішні ІД	OMIM: 605878 MGI: 1335091 HomoloGene: 7820 GeneCards: ZBTB7A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • histone acetyltransferase binding; • зв’язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription corepressor binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • sequence-specific DNA binding; • SMAD binding; • androgen receptor binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • цитоплазма; • NuRD complex; • site of double-strand break; • DNA-dependent protein kinase complex;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • диференціація клітин; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • regulation of glycolytic process; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • ремоделювання хроматину; • cellular response to DNA damage stimulus; • B cell differentiation; • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • protein localization to nucleus; • regulation of apoptotic process; • erythrocyte maturation; • fat cell differentiation; • negative regulation of Notch signaling pathway; • regulation of DNA-binding transcription factor activity; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • negative regulation of androgen receptor signaling pathway; • double-strand break repair via classical nonhomologous end joining; • regulation of transcription regulatory region DNA binding;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	51341
	16969
	ENSG00000178951
	ENSMUSG00000035011
	O95365
	O88939
	NM_015898; NM_001317990; NM_020224
	NM_010731
	NP_001304919; NP_056982
NP_034861; NP_001391790; NP_001391791; NP_001391792; NP_001391793;
	NP_001391794; NP_001391795; NP_001391796
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZBTB7A (англ. Zinc finger and BTB domain containing 7A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 584 амінокислот, а молекулярна маса — 61 439^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGGVDGPIG	IPFPDHSSDI	LSGLNEQRTQ	GLLCDVVILV	EGREFPTHRS
VLAACSQYFK	KLFTSGAVVD	QQNVYEIDFV	SAEALTALMD	FAYTATLTVS
TANVGDILSA	ARLLEIPAVS	HVCADLLDRQ	ILAADAGADA	GQLDLVDQID
QRNLLRAKEY	LEFFQSNPMN	SLPPAAAAAA	ASFPWSAFGA	SDDDLDATKE
AVAAAVAAVA	AGDCNGLDFY	GPGPPAERPP	TGDGDEGDSN	PGLWPERDED
APTGGLFPPP	VAPPAATQNG	HYGRGGEEEA	ASLSEAAPEP	GDSPGFLSGA
AEGEDGDGPD	VDGLAASTLL	QQMMSSVGRA	GAAAGDSDEE	SRADDKGVMD
YYLKYFSGAH	DGDVYPAWSQ	KVEKKIRAKA	FQKCPICEKV	IQGAGKLPRH
IRTHTGEKPY	ECNICKVRFT	RQDKLKVHMR	KHTGEKPYLC	QQCGAAFAHN
YDLKNHMRVH	TGLRPYQCDS	CCKTFVRSDH	LHRHLKKDGC	NGVPSRRGRK
PRVRGGAPDP	SPGATATPGA	PAQPSSPDAR	RNGQEKHFKD	EDEDEDVASP
DGLGRLNVAG	AGGGGDSGGG	PGAATDGNFT	AGLA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
Schubot F.D., Tropea J.E., Waugh D.S. (2006). Structure of the POZ domain of human LRF, a master regulator of oncogenesis. Biochem. Biophys. Res. Commun. 351: 1—6. PMID 17052694 doi:10.1016/j.bbrc.2006.09.167
Stogios P.J., Chen L., Prive G.G. (2007). Crystal structure of the BTB domain from the LRF/ZBTB7 transcriptional regulator. Protein Sci. 16: 336—342. PMID 17189472 doi:10.1110/ps.062660907

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18078 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-16 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O95365 (англ.) . Архів оригіналу за 18 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18078 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-16 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O95365 (англ.) . Архів оригіналу за 18 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]