| DBP
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| DBP, DABP, D-box binding PAR bZIP transcription factor, taxREB302 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 124097 MGI: 94866 HomoloGene: 1035 GeneCards: DBP
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • liver development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ритмічний процес • циркадний ритм • multicellular organism development • transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 48.63 – 48.64 Mb
| Хр. 7: 45.35 – 45.36 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
DBP (англ. D-box binding PAR bZIP transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 34 349[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MARPVSDRTP
|
|
APLLLGGPAG
|
|
TPPGGGALLG
|
|
LRSLLQGTSK
|
|
PKEPASCLLK
|
| EKERKAALPA
|
|
ATTPGPGLET
|
|
AGPADAPAGA
|
|
VVGGGSPRGR
|
|
PGPVPAPGLL
|
| APLLWERTLP
|
|
FGDVEYVDLD
|
|
AFLLEHGLPP
|
|
SPPPPGGPSP
|
|
EPSPARTPAP
|
| SPGPGSCGSA
|
|
SPRSSPGHAP
|
|
ARAALGTASG
|
|
HRAGLTSRDT
|
|
PSPVDPDTVE
|
| VLMTFEPDPA
|
|
DLALSSIPGH
|
|
ETFDPRRHRF
|
|
SEEELKPQPI
|
|
MKKARKIQVP
|
| EEQKDEKYWS
|
|
RRYKNNEAAK
|
|
RSRDARRLKE
|
|
NQISVRAAFL
|
|
EKENALLRQE
|
| VVAVRQELSH
|
|
YRAVLSRYQA
|
|
QHGAL
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Khatib Z.A., Inaba T., Valentine M., Look A.T. (1994). Chromosomal localization and cDNA cloning of the human DBP and TEF genes. Genomics. 23: 344—351. PMID 7835883 doi:10.1006/geno.1994.1510
- Shutler G., Glassco T., Kang X., Korneluk R., Mueller C.R. (1996). Genomic structure of the human D-site binding protein (DBP) gene. Genomics. 34: 334—339. PMID 8786133 doi:10.1006/geno.1996.0295
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Brown S.A., Schibler U. (1999). The ins and outs of circadian timekeeping. Curr. Opin. Genet. Dev. 9: 588—594. PMID 10508692 doi:10.1016/S0959-437X(99)00009-X
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|