| WT1
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
1XF7, 2JP9, 2JPA, 2PRT, 3HPJ, 3MYJ, 4R2E, 4R2P, 4R2Q, 4R2R, 4R2S, 4WUU
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| WT1, AEWS-GUD, NPHS4, WAGR, WIT-2, WT33, Wilms tumor 1, WT1 transcription factor, WT-1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 607102 MGI: 98968 HomoloGene: 11536 GeneCards: WT1
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Frasier syndrome, Denys-Drash syndrome, Meacham syndrome, familial idiopathic steroid-resistant nephrotic syndrome[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • C2H2 zinc finger domain binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • double-stranded methylated DNA binding • hemi-methylated DNA-binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • nuclear speck • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• germ cell development • adrenal cortex formation • ureteric bud development • negative regulation of translation • male gonad development • розвиток чоловічих статевих органів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • epithelial cell differentiation • glomerular basement membrane development • diaphragm development • розвиток нирки • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • posterior mesonephric tubule development • visceral serous pericardium development • metanephric epithelium development • negative regulation of apoptotic process • glomerulus development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • adrenal gland development • transcription, DNA-templated • positive regulation of metanephric ureteric bud development • васкулогенез • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of heart growth • development of the heart • negative regulation of female gonad development • branching involved in ureteric bud morphogenesis • regulation of animal organ formation • Детермінація статі • negative regulation of cell growth • Сплайсинг РНК • cardiac muscle cell fate commitment • гістогенез • positive regulation of apoptotic process • camera-type eye development • metanephric S-shaped body morphogenesis • thorax and anterior abdomen determination • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • gonad development • metanephric mesenchyme development • cellular response to gonadotropin stimulus • positive regulation of male gonad development • cellular response to cAMP • negative regulation of cell population proliferation • mesenchymal to epithelial transition • negative regulation of metanephric glomerular mesangial cell proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • glomerular visceral epithelial cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA methylation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 11: 32.39 – 32.44 Mb
| Хр. 2: 104.96 – 105 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
WT1 (англ. Wilms tumor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 449 амінокислот, а молекулярна маса — 49 188[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MGSDVRDLNA
|
|
LLPAVPSLGG
|
|
GGGCALPVSG
|
|
AAQWAPVLDF
|
|
APPGASAYGS
|
| LGGPAPPPAP
|
|
PPPPPPPPHS
|
|
FIKQEPSWGG
|
|
AEPHEEQCLS
|
|
AFTVHFSGQF
|
| TGTAGACRYG
|
|
PFGPPPPSQA
|
|
SSGQARMFPN
|
|
APYLPSCLES
|
|
QPAIRNQGYS
|
| TVTFDGTPSY
|
|
GHTPSHHAAQ
|
|
FPNHSFKHED
|
|
PMGQQGSLGE
|
|
QQYSVPPPVY
|
| GCHTPTDSCT
|
|
GSQALLLRTP
|
|
YSSDNLYQMT
|
|
SQLECMTWNQ
|
|
MNLGATLKGV
|
| AAGSSSSVKW
|
|
TEGQSNHSTG
|
|
YESDNHTTPI
|
|
LCGAQYRIHT
|
|
HGVFRGIQDV
|
| RRVPGVAPTL
|
|
VRSASETSEK
|
|
RPFMCAYPGC
|
|
NKRYFKLSHL
|
|
QMHSRKHTGE
|
| KPYQCDFKDC
|
|
ERRFSRSDQL
|
|
KRHQRRHTGV
|
|
KPFQCKTCQR
|
|
KFSRSDHLKT
|
| HTRTHTGKTS
|
|
EKPFSCRWPS
|
|
CQKKFARSDE
|
|
LVRHHNMHQR
|
|
NMTKLQLAL
|
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Gessler M., Konig A., Bruns G.A.P. (1992). The genomic organization and expression of the WT1 gene. Genomics. 12: 807—813. PMID 1572653 doi:10.1016/0888-7543(92)90313-H
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Hamilton T.B., Barilla K.C., Romaniuk P.J. (1995). High affinity binding sites for the Wilms' tumour suppressor protein WT1. Nucleic Acids Res. 23: 277—284. PMID 7862533 doi:10.1093/nar/23.2.277
- Buckler A.J., Pelletier J., Haber D.A., Glaser T., Housman D.E. (1991). Isolation, characterization, and expression of the murine Wilms' tumor gene (WT1) during kidney development. Mol. Cell. Biol. 11: 1707—1712. PMID 1671709 doi:10.1128/MCB.11.3.1707
- Sharma P.M., Bowman M., Madden S.L., Rauscher F.J. III, Sukumar S. (1994). RNA editing in the Wilms' tumor susceptibility gene, WT1. Genes Dev. 8: 720—731. PMID 7926762 doi:10.1101/gad.8.6.720
- Bruening W., Pelletier J. (1996). A non-AUG translational initiation event generates novel WT1 isoforms. J. Biol. Chem. 271: 8646—8654. PMID 8621495 doi:10.1074/jbc.271.15.8646
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|