ZBTB20

ZBTB20
Ідентифікатори
Символи	ZBTB20, DPZF, HOF, ODA-8S, ZNF288, PRIMS, zinc finger and BTB domain containing 20
Зовнішні ІД	OMIM: 606025 MGI: 1929213 HomoloGene: 9226 GeneCards: ZBTB20
Пов'язані генетичні захворювання
	Primrose syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця; • цитоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of tumor necrosis factor production; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of interferon-beta production; • positive regulation of glycolytic process; • positive regulation of lipid biosynthetic process; • lipid homeostasis; • cellular response to glucose stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	26137
	56490
	ENSG00000181722
	ENSMUSG00000022708
	Q9HC78
	Q8K0L9
NM_001164342; NM_001164343; NM_001164344; NM_001164345; NM_001164346;
	NM_001164347; NM_015642; NM_001348800; NM_001348802; NM_001348803; NM_001348804; NM_001348805; NM_001348801; NM_001393393; NM_001393394; NM_001393395; NM_001393396
	NM_001285805; NM_019778; NM_181058
NP_001157814; NP_001157815; NP_001157816; NP_001157817; NP_001157818;
	NP_001157819; NP_056457; NP_001335729; NP_001335731; NP_001335732; NP_001335733; NP_001335734; NP_001335730
NP_001272734; NP_062752; NP_851401; NP_001380326; NP_001380327;
	NP_001380328
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZBTB20 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 81 083^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLERKKPKTA	ENQKASEENE	ITQPGGSSAK	PGLPCLNFEA	VLSPDPALIH
STHSLTNSHA	HTGSSDCDIS	CKGMTERIHS	INLHNFSNSV	LETLNEQRNR
GHFCDVTVRI	HGSMLRAHRC	VLAAGSPFFQ	DKLLLGYSDI	EIPSVVSVQS
VQKLIDFMYS	GVLRVSQSEA	LQILTAASIL	QIKTVIDECT	RIVSQNVGDV
FPGIQDSGQD	TPRGTPESGT	SGQSSDTESG	YLQSHPQHSV	DRIYSALYAC
SMQNGSGERS	FYSGAVVSHH	ETALGLPRDH	HMEDPSWITR	IHERSQQMER
YLSTTPETTH	CRKQPRPVRI	QTLVGNIHIK	QEMEDDYDYY	GQQRVQILER
NESEECTEDT	DQAEGTESEP	KGESFDSGVS	SSIGTEPDSV	EQQFGPGAAR
DSQAEPTQPE	QAAEAPAEGG	PQTNQLETGA	SSPERSNEVE	MDSTVITVSN
SSDKSVLQQP	SVNTSIGQPL	PSTQLYLRQT	ETLTSNLRMP	LTLTSNTQVI
GTAGNTYLPA	LFTTQPAGSG	PKPFLFSLPQ	PLAGQQTQFV	TVSQPGLSTF
TAQLPAPQPL	ASSAGHSTAS	GQGEKKPYEC	TLCNKTFTAK	QNYVKHMFVH
TGEKPHQCSI	CWRSFSLKDY	LIKHMVTHTG	VRAYQCSICN	KRFTQKSSLN
VHMRLHRGEK	SYECYICKKK	FSHKTLLERH	VALHSASNGT	PPAGTPPGAR
AGPPGVVACT	EGTTYVCSVC	PAKFDQIEQF	NDHMRMHVSD	G

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZBTB20 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13503 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9HC78 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ZBTB20 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13503 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9HC78 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]