| MSX2
|
|---|
 |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| MSX2, CRS2, FPP, HOX8, MSH, PFM, PFM1, Msh homeobox 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 123101 MGI: 97169 HomoloGene: 1837 GeneCards: MSX2
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Parietal foramina with cleidocranial dysplasia, parietal foramina[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck
|
|---|
| Біологічний процес |
• negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of timing of catagen • negative regulation of keratinocyte differentiation • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • embryonic limb morphogenesis • frontal suture morphogenesis • mammary gland epithelium development • BMP signaling pathway involved in heart development • enamel mineralization • осифікація • anterior/posterior pattern specification • bone morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to growth factor stimulus • activation of meiosis • endochondral bone growth • wound healing, spreading of epidermal cells • BMP signaling pathway • embryonic digit morphogenesis • positive regulation of mesenchymal cell apoptotic process • multicellular organism development • embryonic hindlimb morphogenesis • negative regulation of CREB transcription factor activity • outflow tract morphogenesis • bone trabecula formation • Загоєння ран • regulation of apoptotic process • chondrocyte development • osteoblast development • positive regulation of osteoblast differentiation • cranial suture morphogenesis • negative regulation of fat cell differentiation • branching involved in mammary gland duct morphogenesis • outflow tract septum morphogenesis • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • osteoblast differentiation • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • positive regulation of BMP signaling pathway • signal transduction involved in regulation of gene expression • cellular response to estradiol stimulus • embryonic forelimb morphogenesis • embryonic nail plate morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • cartilage development • stem cell differentiation • odontogenesis • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic morphogenesis
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 5: 174.72 – 174.73 Mb
| н/д
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
MSX2 (англ. Msh homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 267 амінокислот, а молекулярна маса — 28 897[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MASPSKGNDL
|
|
FSPDEEGPAV
|
|
VAGPGPGPGG
|
|
AEGAAEERRV
|
|
KVSSLPFSVE
|
| ALMSDKKPPK
|
|
EASPLPAESA
|
|
SAGATLRPLL
|
|
LSGHGAREAH
|
|
SPGPLVKPFE
|
| TASVKSENSE
|
|
DGAAWMQEPG
|
|
RYSPPPRHMS
|
|
PTTCTLRKHK
|
|
TNRKPRTPFT
|
| TSQLLALERK
|
|
FRQKQYLSIA
|
|
ERAEFSSSLN
|
|
LTETQVKIWF
|
|
QNRRAKAKRL
|
| QEAELEKLKM
|
|
AAKPMLPSSF
|
|
SLPFPISSPL
|
|
QAASIYGASY
|
|
PFHRPVLPIP
|
| PVGLYATPVG
|
|
YGMYHLS
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, остеогенез, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|