| MITF
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| MITF, CMM8, MI, WS2, WS2A, bHLHe32, microphthalmia-associated transcription factor, melanogenesis associated transcription factor, COMMAD, melanocyte inducing transcription factor, MITF-A |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 156845 MGI: 104554 HomoloGene: 4892 GeneCards: MITF
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| Waardenburg syndrome type 2A, Tietz syndrome, mucosal melanoma, MITF-related melanoma and renal cell carcinoma predisposition syndrome, coloboma, osteopetrosis, microphthalmia, macrocephaly, albinism, and deafness; COMMAD[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• regulation of RNA biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-templated transcription, initiation • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • регуляція експресії генів • Wnt • диференціація клітин • osteoclast differentiation • melanocyte differentiation • regulation of cell population proliferation • camera-type eye development • negative regulation of apoptotic process • pigmentation • canonical Wnt signaling pathway involved in negative regulation of apoptotic process • cell fate commitment • regulation of osteoclast differentiation • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ремоделювання кісткової тканини • GO:0034622 protein-containing complex assembly • negative regulation of cell migration
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 3: 69.74 – 69.97 Mb
| Хр. 6: 97.78 – 98 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
MITF (англ. Melanogenesis associated transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 526 амінокислот, а молекулярна маса — 58 795[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQSESGIVPD
|
|
FEVGEEFHEE
|
|
PKTYYELKSQ
|
|
PLKSSSSAEH
|
|
PGASKPPISS
|
| SSMTSRILLR
|
|
QQLMREQMQE
|
|
QERREQQQKL
|
|
QAAQFMQQRV
|
|
PVSQTPAINV
|
| SVPTTLPSAT
|
|
QVPMEVLKVQ
|
|
THLENPTKYH
|
|
IQQAQRQQVK
|
|
QYLSTTLANK
|
| HANQVLSLPC
|
|
PNQPGDHVMP
|
|
PVPGSSAPNS
|
|
PMAMLTLNSN
|
|
CEKEGFYKFE
|
| EQNRAESECP
|
|
GMNTHSRASC
|
|
MQMDDVIDDI
|
|
ISLESSYNEE
|
|
ILGLMDPALQ
|
| MANTLPVSGN
|
|
LIDLYGNQGL
|
|
PPPGLTISNS
|
|
CPANLPNIKR
|
|
ELTACIFPTE
|
| SEARALAKER
|
|
QKKDNHNLIE
|
|
RRRRFNINDR
|
|
IKELGTLIPK
|
|
SNDPDMRWNK
|
| GTILKASVDY
|
|
IRKLQREQQR
|
|
AKELENRQKK
|
|
LEHANRHLLL
|
|
RIQELEMQAR
|
| AHGLSLIPST
|
|
GLCSPDLVNR
|
|
IIKQEPVLEN
|
|
CSQDLLQHHA
|
|
DLTCTTTLDL
|
| TDGTITFNNN
|
|
LGTGTEANQA
|
|
YSVPTKMGSK
|
|
LEDILMDDTL
|
|
SPVGVTDPLL
|
| SSVSPGASKT
|
|
SSRRSSMSME
|
|
ETEHTC
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Wang Y., Radfar S., Liu S., Riker A.I., Khong H.T. (2010). Mitf-Mdel, a novel melanocyte/melanoma-specific isoform of microphthalmia-associated transcription factor-M, as a candidate biomarker for melanoma. BMC Med. 8: 14—14. PMID 20163701 doi:10.1186/1741-7015-8-14
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Lee Y.N., Nechushtan H., Figov N., Razin E. (2004). The function of lysyl-tRNA synthetase and Ap4A as signaling regulators of MITF activity in FcepsilonRI-activated mast cells. Immunity. 20: 145—151. PMID 14975237 doi:10.1016/S1074-7613(04)00020-2
- Miller A.J., Levy C., Davis I.J., Razin E., Fisher D.E. (2005). Sumoylation of MITF and its related family members TFE3 and TFEB. J. Biol. Chem. 280: 146—155. PMID 15507434 doi:10.1074/jbc.M411757200
- Smith S.D., Kelley P.M., Kenyon J.B., Hoover D. (2000). Tietz syndrome (hypopigmentation/deafness) caused by mutation of MITF. J. Med. Genet. 37: 446—448. PMID 10851256 doi:10.1136/jmg.37.6.446
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|