| ZNF219
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| ZNF219, ZFP219, zinc finger protein 219 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 605036 MGI: 1917140 HomoloGene: 9504 GeneCards: ZNF219
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • histamine receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• integral component of membrane • клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• multicellular organism development • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of neurotransmitter levels • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of chondrocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • limb bud formation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 14: 21.09 – 21.1 Mb
| Хр. 14: 52.24 – 52.26 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
ZNF219 (англ. Zinc finger protein 219) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 722 амінокислот, а молекулярна маса — 76 877[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MEGSRPRAPS
|
|
GHLAPSPPAF
|
|
DGELDLQRYS
|
|
NGPAVSAGSL
|
|
GMGAVSWSES
|
| RAGERRFPCP
|
|
VCGKRFRFNS
|
|
ILALHLRAHP
|
|
GAQAFQCPHC
|
|
GHRAAQRALL
|
| RSHLRTHQPE
|
|
RPRSPAARLL
|
|
LELEERALLR
|
|
EARLGRARSS
|
|
GGMQATPATE
|
| GLARPQAPSS
|
|
SAFRCPYCKG
|
|
KFRTSAERER
|
|
HLHILHRPWK
|
|
CGLCSFGSSQ
|
| EEELLHHSLT
|
|
AHGAPERPLA
|
|
ATSAAPPPQP
|
|
QPQPPPQPEP
|
|
RSVPQPEPEP
|
| EPEREATPTP
|
|
APAAPEEPPA
|
|
PPEFRCQVCG
|
|
QSFTQSWFLK
|
|
GHMRKHKASF
|
| DHACPVCGRC
|
|
FKEPWFLKNH
|
|
MKVHASKLGP
|
|
LRAPGPASGP
|
|
ARAPQPPDLG
|
| LLAYEPLGPA
|
|
LLLAPAPTPA
|
|
ERREPPSLLG
|
|
YLSLRAGEGR
|
|
PNGEGAEPGP
|
| GRSFGGFRPL
|
|
SSALPARARR
|
|
HRAEEPEEEE
|
|
EVVEAEEETW
|
|
ARGRSLGSLA
|
| SLHPRPGEGP
|
|
GHSASAAGAQ
|
|
ARSTATQEEN
|
|
GLLVGGTRPE
|
|
GGRGATGKDC
|
| PFCGKSFRSA
|
|
HHLKVHLRVH
|
|
TGERPYKCPH
|
|
CDYAGTQSGS
|
|
LKYHLQRHHR
|
| EQRSGAGPGP
|
|
PPEPPPPSQR
|
|
GSAPQSGAKP
|
|
SPQPATWVEG
|
|
ASSPRPPSSG
|
| AGPGSRRKPA
|
|
SPGRTLRNGR
|
|
GGEAEPLDLS
|
|
LRAGPGGEAG
|
|
PGGALHRCLF
|
| CPFATGAPEL
|
|
MALHLQVHHS
|
|
RRARGRRPPQ
|
|
ADASPPYARV
|
|
PSGETPPSPS
|
| QEGEEGSGLS
|
|
RPGEAGLGGQ
|
|
ER
|
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Sakai T., Toyoda A., Hashimoto K., Maeda H. (2000). Isolation and characterization of a novel zinc finger gene, ZNF219, and mapping to the human chromosome 14q11 region. DNA Res. 7: 137—141. PMID 10819330 doi:10.1093/dnares/7.2.137
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|