HOXB5

HOXB5
Ідентифікатори
Символи	HOXB5, HHO.C10, HOX2, HOX2A, HU-1, Hox2.1, homeobox B5
Зовнішні ІД	OMIM: 142960 MGI: 96186 HomoloGene: 37585 GeneCards: HOXB5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding;
Клітинна компонента	• fibrillar center; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • anatomical structure morphogenesis; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • embryonic skeletal system development; • endothelial cell differentiation; • anterior/posterior pattern specification; • embryonic skeletal system morphogenesis; • transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3215
	15413
	ENSG00000120075
	ENSMUSG00000038700
	P09067
	P09079
	NM_002147
	NM_008268
	NP_002138
	NP_032294
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXB5 (англ. Homeobox B5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 269 амінокислот, а молекулярна маса — 29 434^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSYFVNSFS	GRYPNGPDYQ	LLNYGSGSSL	SGSYRDPAAM	HTGSYGYNYN
GMDLSVNRSS	ASSSHFGAVG	ESSRAFPAPA	QEPRFRQAAS	SCSLSSPESL
PCTNGDSHGA	KPSASSPSDQ	ATSASSSANF	TEIDEASASS	EPEEAASQLS
SPSLARAQPE	PMATSTAAPE	GQTPQIFPWM	RKLHISHDMT	GPDGKRARTA
YTRYQTLELE	KEFHFNRYLT	RRRRIEIAHA	LCLSERQIKI	WFQNRRMKWK
KDNKLKSMSL	ATAGSAFQP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Levine M., Rubin G.M., Tjian R. (1984). Human DNA sequences homologous to a protein coding region conserved between homeotic genes of Drosophila. Cell. 38: 667—673. PMID 6091895 doi:10.1016/0092-8674(84)90261-7
Galang C.K., Hauser C.A. (1992). Cooperative DNA binding of the highly conserved human Hox 2.1 homeodomain gene product. New Biol. 4: 558—568. PMID 1355360

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5116 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P09067 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5116 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P09067 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]