| SIX2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| SIX2, SIX homeobox 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 604994 MGI: 102778 HomoloGene: 56518 GeneCards: SIX2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • transcription regulator complex
|
|---|
| Біологічний процес |
• embryonic skeletal system morphogenesis • regulation of chondrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of chondrocyte proliferation • chondrocyte differentiation • protein import into nucleus • розвиток нирки • negative regulation of cell differentiation • anatomical structure morphogenesis • mesenchymal stem cell maintenance involved in nephron morphogenesis • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • mesenchymal cell differentiation involved in kidney development • mesenchymal stem cell proliferation • transcription by RNA polymerase II • regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • multicellular organism development • nephron morphogenesis • nephron development • middle ear morphogenesis • embryonic digestive tract morphogenesis • embryonic cranial skeleton morphogenesis • regulation of ossification • проліферація • mesodermal cell fate specification • anterior/posterior axis specification • metanephros development • cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • condensed mesenchymal cell proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:1903374 anatomical structure development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|

 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 45.01 – 45.01 Mb
| Хр. 17: 85.99 – 86 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
SIX2 (англ. SIX homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 286[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MSMLPTFGFT
|
|
QEQVACVCEV
|
|
LQQGGNIERL
|
|
GRFLWSLPAC
|
|
EHLHKNESVL
|
| KAKAVVAFHR
|
|
GNFRELYKIL
|
|
ESHQFSPHNH
|
|
AKLQQLWLKA
|
|
HYIEAEKLRG
|
| RPLGAVGKYR
|
|
VRRKFPLPRS
|
|
IWDGEETSYC
|
|
FKEKSRSVLR
|
|
EWYAHNPYPS
|
| PREKRELAEA
|
|
TGLTTTQVSN
|
|
WFKNRRQRDR
|
|
AAEAKERENN
|
|
ENSNSNSHNP
|
| LNGSGKSVLG
|
|
SSEDEKTPSG
|
|
TPDHSSSSPA
|
|
LLLSPPPPGL
|
|
PSLHSLGHPP
|
| GPSAVPVPVP
|
|
GGGGADPLQH
|
|
HHGLQDSILN
|
|
PMSANLVDLG
|
|
S
|
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|