BATF

BATF
Ідентифікатори
Символи	BATF, B-ATF, BATF1, SFA-2, SFA2, basic leucine zipper ATF-like transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 612476 MGI: 1859147 HomoloGene: 4666 GeneCards: BATF
Пов'язані генетичні захворювання
	розсіяний склероз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • диференціація клітин; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • T-helper 2 cell differentiation; • GO:0032617 творба цитокінів; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • myeloid dendritic cell differentiation; • lymphoid progenitor cell differentiation; • T-helper 17 cell lineage commitment; • cellular response to DNA damage stimulus; • hematopoietic stem cell differentiation; • Перемикання класу імуноглобулінів; • T-helper 17 cell differentiation; • defense response to protozoan; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10538
	53314
	ENSG00000156127
	ENSMUSG00000034266
	Q16520
	O35284
	NM_006399
	NM_016767
	NP_006390
	NP_058047
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BATF (англ. Basic leucine zipper ATF-like transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 125 амінокислот, а молекулярна маса — 14 120^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPHSSDSSDS	SFSRSPPPGK	QDSSDDVRRV	QRREKNRIAA	QKSRQRQTQK
ADTLHLESED	LEKQNAALRK	EIKQLTEELK	YFTSVLNSHE	PLCSVLAAST
PSPPEVVYSA	HAFHQPHVSS	PRFQP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wang X., Johansen L.M., Tae H.-J., Taparowsky E.J. (1996). IFP 35 forms complexes with B-ATF, a member of the AP1 family of transcription factors. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229: 316—322. PMID 8954125 doi:10.1006/bbrc.1996.1799
Echlin D.R., Tae H.-J., Mitin N., Taparowsky E.J. (2000). B-ATF functions as a negative regulator of AP-1 mediated transcription and blocks cellular transformation by Ras and Fos. Oncogene. 19: 1752—1763. PMID 10777209 doi:10.1038/sj.onc.1203491

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з BATF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:958 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-20 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q16520 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

[1] Захворювання, генетично пов'язані з BATF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:958 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-20 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q16520 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]