| KLF2
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| KLF2, LKLF, Kruppel-like factor 2, Kruppel like factor 2 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 602016 MGI: 1342772 HomoloGene: 133978 GeneCards: KLF2
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв’язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Епігенетичне успадкування • multicellular organism growth • cellular response to laminar fluid shear stress • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • negative regulation of interleukin-6 production • cellular response to tumor necrosis factor • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • response to laminar fluid shear stress • in utero embryonic development • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • erythrocyte homeostasis • type I pneumocyte differentiation • cellular response to interleukin-1 • GO:0000767 cell morphogenesis • cellular response to cycloheximide • cellular response to hydrogen peroxide • erythrocyte maturation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to fluid shear stress • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular stress response to acid chemical • negative regulation of sprouting angiogenesis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 19: 16.32 – 16.33 Mb
| Хр. 8: 73.07 – 73.08 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
KLF2 (англ. Kruppel like factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 355 амінокислот, а молекулярна маса — 37 420[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MALSEPILPS
|
|
FSTFASPCRE
|
|
RGLQERWPRA
|
|
EPESGGTDDD
|
|
LNSVLDFILS
|
| MGLDGLGAEA
|
|
APEPPPPPPP
|
|
PAFYYPEPGA
|
|
PPPYSAPAGG
|
|
LVSELLRPEL
|
| DAPLGPALHG
|
|
RFLLAPPGRL
|
|
VKAEPPEADG
|
|
GGGYGCAPGL
|
|
TRGPRGLKRE
|
| GAPGPAASCM
|
|
RGPGGRPPPP
|
|
PDTPPLSPDG
|
|
PARLPAPGPR
|
|
ASFPPPFGGP
|
| GFGAPGPGLH
|
|
YAPPAPPAFG
|
|
LFDDAAAAAA
|
|
ALGLAPPAAR
|
|
GLLTPPASPL
|
| ELLEAKPKRG
|
|
RRSWPRKRTA
|
|
THTCSYAGCG
|
|
KTYTKSSHLK
|
|
AHLRTHTGEK
|
| PYHCNWDGCG
|
|
WKFARSDELT
|
|
RHYRKHTGHR
|
|
PFQCHLCDRA
|
|
FSRSDHLALH
|
| MKRHM
|
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Kozyrev S.V., Hansen L.L., Poltaraus A.B., Domninsky D.A., Kisselev L.L. (1999). Structure of the human CpG-island-containing lung Kruppel-like factor (LKLF) gene and its location in chromosome 19p13.11-13 locus. FEBS Lett. 448: 149—152. PMID 10217429 doi:10.1016/S0014-5793(99)00348-8
- Wani M.A., Conkright M.D., Jeffries S., Hughes M.J., Lingrel J.B. (1999). cDNA isolation, genomic structure, regulation, and chromosomal localization of human lung kruppel-like factor. Genomics. 60: 78—86. PMID 10458913 doi:10.1006/geno.1999.5888
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Conkright M.D., Wani M.A., Lingrel J.B. (2001). Lung Krueppel-like factor contains an autoinhibitory domain that regulates its transcriptional activation by binding WWP1, an E3 ubiquitin ligase. J. Biol. Chem. 276: 29299—29306. PMID 11375995 doi:10.1074/jbc.M103670200
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|