HOXD9

HOXD9
Ідентифікатори
Символи	HOXD9, HOX4, HOX4C, Hox-4.3, Hox-5.2, homeobox D9
Зовнішні ІД	OMIM: 142982 MGI: 96210 HomoloGene: 8409 GeneCards: HOXD9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • ядерце;
Біологічний процес	• embryonic skeletal system morphogenesis; • forelimb morphogenesis; • peripheral nervous system neuron development; • proximal/distal pattern formation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • adult locomotory behavior; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • hindlimb morphogenesis; • transcription, DNA-templated; • single fertilization; • embryonic skeletal system development; • mammary gland development; • multicellular organism development; • регуляція експресії генів; • skeletal muscle tissue development; • embryonic forelimb morphogenesis; • anterior/posterior pattern specification; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3235
	15438
	ENSG00000128709
	ENSMUSG00000043342
	P28356
	P28357
	NM_014213
	NM_013555
	NP_055028
	NP_038583
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXD9 (англ. Homeobox D9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 36 495^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLGGSAGRLK	MSSSGTLSNY	YVDSLIGHEG	DEVFAARFGP	PGPGAQGRPA
GVADGPAATA	AEFASCSFAP	RSAVFSASWS	AVPSQPPAAA	AMSGLYHPYV
PPPPLAASAS	EPGRYVRSWM	EPLPGFPGGA	GGGGGGGGGG	PGRGPSPGPS
GPANGRHYGI	KPETRAAPAP	ATAASTTSSS	STSLSSSSKR	TECSVARESQ
GSSGPEFSCN	SFLQEKAAAA	TGGTGPGAGI	GAATGTGGSS	EPSACSDHPI
PGCSLKEEEK	QHSQPQQQQL	DPNNPAANWI	HARSTRKKRC	PYTKYQTLEL
EKEFLFNMYL	TRDRRYEVAR	ILNLTERQVK	IWFQNRRMKM	KKMSKEKCPK
GD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5140 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P28356 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5140 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P28356 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]