| GLIS1
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| GLIS1, GLIS family zinc finger 1 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 610378 MGI: 2386723 HomoloGene: 77390 GeneCards: GLIS1
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • osteoblast differentiation • negative regulation of cell fate commitment • fat cell differentiation • диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 53.51 – 53.74 Mb
| Хр. 4: 107.29 – 107.49 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
GLIS1 (англ. GLIS family zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 620 амінокислот, а молекулярна маса — 65 976[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAEARTSLSA
|
|
HCRGPLATGL
|
|
HPDLDLPGRS
|
|
LATPAPSCYL
|
|
LGSEPSSGLG
|
| LQPETHLPEG
|
|
SLKRCCVLGL
|
|
PPTSPASSSP
|
|
CASSDVTSII
|
|
RSSQTSLVTC
|
| VNGLRSPPLT
|
|
GDLGGPSKRA
|
|
RPGPASTDSH
|
|
EGSLQLEACR
|
|
KASFLKQEPA
|
| DEFSELFGPH
|
|
QQGLPPPYPL
|
|
SQLPPGPSLG
|
|
GLGLGLAGRV
|
|
VAGRQACRWV
|
| DCCAAYEQQE
|
|
ELVRHIEKSH
|
|
IDQRKGEDFT
|
|
CFWAGCVRRY
|
|
KPFNARYKLL
|
| IHMRVHSGEK
|
|
PNKCMFEGCS
|
|
KAFSRLENLK
|
|
IHLRSHTGEK
|
|
PYLCQHPGCQ
|
| KAFSNSSDRA
|
|
KHQRTHLDTK
|
|
PYACQIPGCS
|
|
KRYTDPSSLR
|
|
KHVKAHSAKE
|
| QQVRKKLHAG
|
|
PDTEADVLTE
|
|
CLVLQQLHTS
|
|
TQLAASDGKG
|
|
GCGLGQELLP
|
| GVYPGSITPH
|
|
NGLASGLLPP
|
|
AHDVPSRHHP
|
|
LDATTSSHHH
|
|
LSPLPMAEST
|
| RDGLGPGLLS
|
|
PIVSPLKGLG
|
|
PPPLPPSSQS
|
|
HSPGGQPFPT
|
|
LPSKPSYPPF
|
| QSPPPPPLPS
|
|
PQGYQGSFHS
|
|
IQSCFPYGDC
|
|
YRMAEPAAGG
|
|
DGLVGETHGF
|
| NPLRPNGYHS
|
|
LSTPLPATGY
|
|
EALAEASCPT
|
|
ALPQQPSEDV
|
|
VSSGPEDCGF
|
| FPNGAFDHCL
|
|
GHIPSIYTDT
|
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|