RARA

RARA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи RARA, NR1B1, RAR, retinoic acid receptor alpha, RARalpha
Зовнішні ІД OMIM: 180240 MGI: 97856 HomoloGene: 20262 GeneCards: RARA
Реагує на сполуку
Адапален, alitretinoin, tamibarotene, tazarotene, третиноїн[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5914
19401
Ensembl
ENSG00000131759
ENSMUSG00000037992
UniProt
P10276
Q6I9R7
P11416
RefSeq (мРНК)
NM_000964
NM_001024809
NM_001033603
NM_001145301
NM_001145302
NM_001176528
NM_001177302
NM_001177303
NM_009024
NM_001361954
RefSeq (білок)
NP_001169999
NP_001170773
NP_001170774
NP_033050
NP_001348883
Локус (UCSC) Хр. 17: 40.31 – 40.36 Mb Хр. 11: 98.82 – 98.87 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RARA (англ. Retinoic acid receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 50 771[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MASNSSSCPT PGGGHLNGYP VPPYAFFFPP MLGGLSPPGA LTTLQHQLPV
SGYSTPSPAT IETQSSSSEE IVPSPPSPPP LPRIYKPCFV CQDKSSGYHY
GVSACEGCKG FFRRSIQKNM VYTCHRDKNC IINKVTRNRC QYCRLQKCFE
VGMSKESVRN DRNKKKKEVP KPECSESYTL TPEVGELIEK VRKAHQETFP
ALCQLGKYTT NNSSEQRVSL DIDLWDKFSE LSTKCIIKTV EFAKQLPGFT
TLTIADQITL LKAACLDILI LRICTRYTPE QDTMTFSDGL TLNRTQMHNA
GFGPLTDLVF AFANQLLPLE MDDAETGLLS AICLICGDRQ DLEQPDRVDM
LQEPLLEALK VYVRKRRPSR PHMFPKMLMK ITDLRSISAK GAERVITLKM
EIPGSMPPLI QEMLENSEGL DTLSGQPGGG GRDGGGLAPP PGSCSPSLSP
SSNRSSPATH SP

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Giguere V., Ong E.S., Segui P., Evans R.M. (1987). Identification of a receptor for the morphogen retinoic acid. Nature. 330: 624—629. PMID 2825036 doi:10.1038/330624a0
  • Hjalt T.A.H., Murray J.C. (1999). Genomic structure of the human retinoic acid receptor-alpha1 gene. Mamm. Genome. 10: 528—529. PMID 10337631 doi:10.1007/s003359901036
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Brand N.J., Petkovich M., Chambon P. (1990). Characterization of a functional promoter for the human retinoic acid receptor-alpha (hRAR-alpha). Nucleic Acids Res. 18: 6799—6806. PMID 2175878 doi:10.1093/nar/18.23.6799
  • Petkovich M., Brand N.J., Krust A., Chambon P. (1987). A human retinoic acid receptor which belongs to the family of nuclear receptors. Nature. 330: 444—450. PMID 2825025 doi:10.1038/330444a0
  • Shao W., Halachmi S., Brown M. (2002). ERAP140, a conserved tissue-specific nuclear receptor coactivator. Mol. Cell. Biol. 22: 3358—3372. PMID 11971969 doi:10.1128/MCB.22.10.3358-3372.2002

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з retinoic acid receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9864 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, P10276 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також