KLF1

KLF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2L2I, 2MBH, 2N23
Ідентифікатори
Символи	KLF1, CDAN4, EKLF, HBFQTL6, INLU, Kruppel-like factor 1 (erythroid), Kruppel like factor 1, EKLF/KLF1
Зовнішні ІД	OMIM: 600599 MGI: 1342771 HomoloGene: 4785 GeneCards: KLF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв’язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • erythrocyte differentiation; • cellular response to peptide; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • maternal process involved in female pregnancy; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10661
	16596
	ENSG00000105610
	ENSMUSG00000054191
	Q13351
	P46099
	NM_006563
	NM_010635
	NP_006554
	NP_034765
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KLF1 (англ. Kruppel like factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 38 221^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATAETALPS	ISTLTALGPF	PDTQDDFLKW	WRSEEAQDMG	PGPPDPTEPP
LHVKSEDQPG	EEEDDERGAD	ATWDLDLLLT	NFSGPEPGGA	PQTCALAPSE
ASGAQYPPPP	ETLGAYAGGP	GLVAGLLGSE	DHSGWVRPAL	RARAPDAFVG
PALAPAPAPE	PKALALQPVY	PGPGAGSSGG	YFPRTGLSVP	AASGAPYGLL
SGYPAMYPAP	QYQGHFQLFR	GLQGPAPGPA	TSPSFLSCLG	PGTVGTGLGG
TAEDPGVIAE	TAPSKRGRRS	WARKRQAAHT	CAHPGCGKSY	TKSSHLKAHL
RTHTGEKPYA	CTWEGCGWRF	ARSDELTRHY	RKHTGQRPFR	CQLCPRAFSR
SDHLALHMKR	HL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Bieker J.J. (1996). Isolation, genomic structure, and expression of human erythroid Kruppel-like factor (EKLF). DNA Cell Biol. 15: 347—352. PMID 8924208 doi:10.1089/dna.1996.15.347
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Zhang W., Bieker J.J. (1998). Acetylation and modulation of erythroid Krueppel-like factor (EKLF) activity by interaction with histone acetyltransferases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 9855—9860. PMID 9707565 doi:10.1073/pnas.95.17.9855
Singleton B.K., Burton N.M., Green C., Brady R.L., Anstee D.J. (2008). Mutations in EKLF/KLF1 form the molecular basis of the rare blood group In(Lu) phenotype. Blood. 112: 2081—2088. PMID 18487511 doi:10.1182/blood-2008-03-145672

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6345 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13351 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6345 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q13351 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]