ARID4A

ARID4A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LCC, 2MAM, 2YRV
Ідентифікатори
Символи	ARID4A, RBBP-1, RBBP1, RBP-1, RBP1, AT-rich interaction domain 4A
Зовнішні ІД	OMIM: 180201 MGI: 2444354 HomoloGene: 11303 GeneCards: ARID4A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • histone deacetylase activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• transcription repressor complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• histone H3-K9 trimethylation; • establishment of Sertoli cell barrier; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of gene expression by genetic imprinting; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • erythrocyte development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • Сперматогенез; • histone H4-K20 trimethylation; • histone H3-K4 trimethylation; • transcription, DNA-templated; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • histone deacetylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • диференціація клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5926
	238247
	ENSG00000032219
	ENSMUSG00000048118
	P29374
	F8VPQ2
	NM_002892; NM_023000; NM_023001
	NM_001081195
	NP_002883; NP_075376; NP_075377
	NP_001074664
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARID4A (англ. AT-rich interaction domain 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 257 амінокислот, а молекулярна маса — 142 752^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKAADEPAYL	TVGTDVSAKY	RGAFCEAKIK	TVKRLVKVKV	LLKQDNTTQL
VQDDQVKGPL	RVGAIVETRT	SDGSFQEAII	SKLTDASWYT	VVFDDGDERT
LRRTSLCLKG	ERHFAESETL	DQLPLTNPEH	FGTPVIAKKT	NRGRRSSLPV
TEDEKEEESS	EEEDEDKRRL	NDELLGKVVS	VVSATERTEW	YPALVISPSC
NDDITVKKDQ	CLVRSFIDSK	FYSIARKDIK	EVDILNLPES	ELSTKPGLQK
ASIFLKTRVV	PDNWKMDISE	ILESSSSDDE	DGPAEENDEE	KEKEAKKTEE
EVPEEELDPE	ERDNFLQQLY	KFMEDRGTPI	NKPPVLGYKD	LNLFKLFRLV
YHQGGCDNID	SGAVWKQIYM	DLGIPILNSA	ASYNVKTAYR	KYLYGFEEYC
RSANIQFRTV	HHHEPKVKEE	KKDLEESMEE	ALKLDQEMPL	TEVKSEPEEN
IDSNSESERE	EIELKSPRGR	RRIARDVNSI	KKEIEEEKTE	DKLKDNDTEN
KDVDDDYETA	EKKENELLLG	RKNTPKQKEK	KIKKQEDSDK	DSDEEEEKSQ
EREETESKCD	SEGEEDEEDM	EPCLTGTKVK	VKYGRGKTQK	IYEASIKSTE
IDDGEVLYLV	HYYGWNVRYD	EWVKADRIIW	PLDKGGPKKK	QKKKAKNKED
SEKDEKRDEE	RQKSKRGRPP	LKSTLSSNMP	YGLSKTANSE	GKSDSCSSDS
ETEDALEKNL	INEELSLKDE	LEKNENLNDD	KLDEENPKIS	AHILKENDRT
QMQPLETLKL	EVGENEQIVQ	IFGNKMEKTE	EVKKEAEKSP	KGKGRRSKTK
DLSLEIIKIS	SFGQNEAGSE	PHIEAHSLEL	SSLDNKNFSS	ATEDEIDQCV
KEKKLKRKIL	GQSSPEKKIR	IENGMEMTNT	VSQERTSDCI	GSEGMKNLNF
EQHFERENEG	MPSLIAESNQ	CIQQLTSERF	DSPAEETVNI	PLKEDEDAMP
LIGPETLVCH	EVDLDDLDEK	DKTSIEDVAV	ESSESNSLVS	IPPALPPVVQ
HNFSVASPLT	LSQDESRSVK	SESDITIEVD	SIAEESQEGL	CERESANGFE
TNVASGTCSI	IVQERESREK	GQKRPSDGNS	GLMAKKQKRT	PKRTSAAAKN
EKNGTGQSSD	SEDLPVLDNS	SKCTPVKHLN	VSKPQKLARS	PARISPHIKD
GEKDKHREKH	PNSSPRTYKW	SFQLNELDNM	NSTERISFLQ	EKLQEIRKYY
MSLKSEVATI	DRRRKRLKKK	DREVSHAGAS	MSSASSDTGM	SPSSSSPPQN
VLAVECR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Otterson G.A., Kratzke R.A., Lin A.Y., Johnston P.G., Kaye F.J. (1993). Alternative splicing of the RBP1 gene clusters in an internal exon that encodes potential phosphorylation sites. Oncogene. 8: 949—957. PMID 8455946

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9885 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P29374 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9885 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P29374 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]