| EGR4
|
|---|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| EGR4, NGFI-C, NGFIC, PAT133, early growth response 4, Early growth response protein 4, AT133 |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 128992 MGI: 99252 HomoloGene: 1485 GeneCards: EGR4
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв’язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
|---|
| Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to growth factor stimulus
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 73.29 – 73.29 Mb
| Хр. 6: 85.49 – 85.49 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
EGR4 (англ. Early growth response 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 61 623[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MAVARGVGSP
|
|
EPAPPQLYKW
|
|
GGCGLGEPGS
|
|
ALERRGAAAR
|
|
GRCGRARAPR
|
| LPDSFPRGEC
|
|
PKPGARAPRS
|
|
VRCGEPLPPA
|
|
SPPPARPQAQ
|
|
RARPRAPHSR
|
| RRAMLHLSEF
|
|
SEPDALLVKS
|
|
TEGCCAEPSA
|
|
ELPRLPARDA
|
|
PAATGYPGAG
|
| DFLSWALNSC
|
|
GASGDLADSC
|
|
FLEGPAPTPP
|
|
PGLSYSGSFF
|
|
IQAVPEHPHD
|
| PEALFNLMSG
|
|
ILGLAPFPGP
|
|
EAAASRSPLD
|
|
APFPAGSDAL
|
|
LPGPPDLYSP
|
| DLGAAPFPEA
|
|
FWEASPCAGA
|
|
PSQCLYEPQL
|
|
SPPDVKPGLR
|
|
APPASPALDA
|
| VSAFKGPYAP
|
|
WELLSVGAPG
|
|
NCGSQGDYQA
|
|
APEARFPVIG
|
|
TKIEDLLSIS
|
| CPAELPAVPA
|
|
NRLYPSGAYD
|
|
AFPLAPGDLG
|
|
EGAEGLPGLL
|
|
TPPSGEGGSS
|
| GDGGEFLAST
|
|
QPQLSPLGLR
|
|
SAAAADFPKP
|
|
LVADIPGSSG
|
|
VAAPPVPPPP
|
| PTPFPQAKAR
|
|
RKGRRGGKCS
|
|
TRCFCPRPHA
|
|
KAFACPVESC
|
|
VRSFARSDEL
|
| NRHLRIHTGH
|
|
KPFQCRICLR
|
|
NFSRSDHLTT
|
|
HVRTHTGEKP
|
|
FACDVCGRRF
|
| ARSDEKKRHS
|
|
KVHLKQKARA
|
|
EERLKGLGFY
|
|
SLGLSFASL
|
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- Holst C., Skerka C., Lichter P., Bialonski A., Zipfel P.F. (1993). Genomic organization, chromosomal localization and promoter function of the human zinc-finger gene pAT133. Hum. Mol. Genet. 2: 367—372. PMID 8504297 doi:10.1093/hmg/2.4.367
- Mueller H.-J., Skerka C., Bialonski A., Zipfel P.F. (1991). Clone pAT133 identifies a gene that encodes another human member of a class of growth factor-induced genes with almost identical zinc-finger domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10079—10083. PMID 1658795 doi:10.1073/pnas.88.22.10079
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|