KLF6

KLF6
Ідентифікатори
Символи	KLF6, BCD1, CBA1, COPEB, CPBP, GBF, PAC1, ST12, ZF9, Kruppel-like factor 6, Kruppel like factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 602053 MGI: 1346318 HomoloGene: 996 GeneCards: KLF6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • зв’язування дволанцюгових ДНК;
Клітинна компонента	• fibrillar center; • клітинне ядро; • ядерце; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • B cell differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1316
	23849
	ENSG00000067082
	ENSMUSG00000000078
	Q99612
	O08584; Q8BPQ2
	NM_001008490; NM_001160124; NM_001160125; NM_001300
	NM_011803
	NP_001153596; NP_001153597; NP_001291
	NP_035933
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KLF6 (англ. Kruppel like factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот, а молекулярна маса — 31 865^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVLPMCSIF	QELQIVHETG	YFSALPSLEE	YWQQTCLELE	RYLQSEPCYV
SASEIKFDSQ	EDLWTKIILA	REKKEESELK	ISSSPPEDTL	ISPSFCYNLE
TNSLNSDVSS	ESSDSSEELS	PTAKFTSDPI	GEVLVSSGKL	SSSVTSTPPS
SPELSREPSQ	LWGCVPGELP	SPGKVRSGTS	GKPGDKGNGD	ASPDGRRRVH
RCHFNGCRKV	YTKSSHLKAH	QRTHTGEKPY	RCSWEGCEWR	FARSDELTRH
FRKHTGAKPF	KCSHCDRCFS	RSDHLALHMK	RHL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
El Rouby S., Newcomb E.W. (1996). Identification of Bcd, a novel proto-oncogene expressed in B-cells. Oncogene. 13: 2623—2630. PMID 9000136

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2235 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99612 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2235 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q99612 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]