| RXRG
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| RXRG, NR2B3, RXRC, Retinoid X receptor gamma, RXR-gamma, RXRgamma |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 180247 MGI: 98216 HomoloGene: 21373 GeneCards: RXRG
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| синдром набутого імунного дефіциту[1] |
|
|
| Реагує на сполуку |
|---|
| alitretinoin, bexarotene[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв’язування з іоном металу • sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
|---|
| Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма
|
|---|
| Біологічний процес |
• retinoic acid receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein homotetramerization • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus • transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 1: 165.4 – 165.45 Mb
| Хр. 1: 167.43 – 167.47 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[3]
| [4] |
|---|
| Вікідані |
|
RXRG (англ. Retinoid X receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 463 амінокислот, а молекулярна маса — 50 871[6].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MYGNYSHFMK
|
|
FPAGYGGSPG
|
|
HTGSTSMSPS
|
|
AALSTGKPMD
|
|
SHPSYTDTPV
|
| SAPRTLSAVG
|
|
TPLNALGSPY
|
|
RVITSAMGPP
|
|
SGALAAPPGI
|
|
NLVAPPSSQL
|
| NVVNSVSSSE
|
|
DIKPLPGLPG
|
|
IGNMNYPSTS
|
|
PGSLVKHICA
|
|
ICGDRSSGKH
|
| YGVYSCEGCK
|
|
GFFKRTIRKD
|
|
LIYTCRDNKD
|
|
CLIDKRQRNR
|
|
CQYCRYQKCL
|
| VMGMKREAVQ
|
|
EERQRSRERA
|
|
ESEAECATSG
|
|
HEDMPVERIL
|
|
EAELAVEPKT
|
| ESYGDMNMEN
|
|
STNDPVTNIC
|
|
HAADKQLFTL
|
|
VEWAKRIPHF
|
|
SDLTLEDQVI
|
| LLRAGWNELL
|
|
IASFSHRSVS
|
|
VQDGILLATG
|
|
LHVHRSSAHS
|
|
AGVGSIFDRV
|
| LTELVSKMKD
|
|
MQMDKSELGC
|
|
LRAIVLFNPD
|
|
AKGLSNPSEV
|
|
ETLREKVYAT
|
| LEAYTKQKYP
|
|
EQPGRFAKLL
|
|
LRLPALRSIG
|
|
LKCLEHLFFF
|
|
KLIGDTPIDT
|
| FLMEMLETPL
|
|
QIT
|
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
|---|
(1) Основні домени |
|---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
|---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
|---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
|---|
| (1.4) NF-1 | |
|---|
| (1.5) RF-X | |
|---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
|---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
|---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | | підродина 1 | |
|---|
| підродина 2 | |
|---|
| підродина 3 | |
|---|
| підродина 4 | |
|---|
| підродина 5 | |
|---|
| підродина 6 | |
|---|
| підродина 0 | |
|---|
|
|---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
|---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
|---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
|---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
|---|
| (2.6) WRKY | |
|---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
|---|
| (3.1) Гомеобокс | |
|---|
| (3.2) Парний бокс | |
|---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
|---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
|---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
|---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
|---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
|---|
| (4.1) RHR | |
|---|
| (4.2) STAT | |
|---|
| (4.3) p53 | |
|---|
| (4.4) MADS | |
|---|
| (4.6) TATA | |
|---|
| (4.7) Високомобільна група | |
|---|
| (4.9) Grainyhead | |
|---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
|---|
| (4.11) Runt | |
|---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
|---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
|---|
| (0.3) Pocket домен | |
|---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
|---|
| (0.6) Інші | |
|---|
|
|