ZNF143

ZNF143
Ідентифікатори
Символи	ZNF143, SBF, STAF, pHZ-1, zinc finger protein 143
Зовнішні ІД	OMIM: 603433 MGI: 1277969 HomoloGene: 56444 GeneCards: ZNF143
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of transcription by RNA polymerase III; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase III; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7702
	20841
	ENSG00000166478
	ENSMUSG00000061079
	P52747
	O70230
	NM_001282656; NM_001282657; NM_003442
	NM_009281; NM_001374618
	NP_001269585; NP_001269586; NP_003433
	NP_033307; NP_001361547; NP_001392700; NP_001392701
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZNF143 (англ. Zinc finger protein 143) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 638 амінокислот, а молекулярна маса — 68 896^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLAQINRDS	QGMTEFPGGG	MEAQHVTLCL	TEAVTVADGD	NLENMEGVSL
QAVTLADGST	AYIQHNSKDA	KLIDGQVIQL	EDGSAAYVQH	VPIPKSTGDS
LRLEDGQAVQ	LEDGTTAFIH	HTSKDSYDQS	ALQAVQLEDG	TTAYIHHAVQ
VPQSDTILAI	QADGTVAGLH	TGDATIDPDT	ISALEQYAAK	VSIDGSESVA
GTGMIGENEQ	EKKMQIVLQG	HATRVTAKSQ	QSGEKAFRCE	YDGCGKLYTT
AHHLKVHERS	HTGDRPYQCE	HAGCGKAFAT	GYGLKSHVRT	HTGEKPYRCS
EDNCTKSFKT	SGDLQKHIRT	HTGERPFKCP	FEGCGRSFTT	SNIRKVHVRT
HTGERPYYCT	EPGCGRAFAS	ATNYKNHVRI	HTGEKPYVCT	VPGCDKRFTE
YSSLYKHHVV	HTHSKPYNCN	HCGKTYKQIS	TLAMHKRTAH	NDTEPIEEEQ
EAFFEPPPGQ	GEDVLKGSQI	TYVTGVEGDD	VVSTQVATVT	QSGLSQQVTL
ISQDGTQHVN	ISQADMQAIG	NTITMVTQDG	TPITVPAHDA	VISSAGTHSV
AMVTAEGTEG	EQVAIVAQDL	AAFHTASSEM	GHQQHSHHLV	TTETRPLTLV
ATSNGTQIAV	QLGEQPSLEE	AIRIASRIQQ	GETPGLDD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tommerup N., Vissing H. (1995). Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger-encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders. Genomics. 27: 259—264. PMID 7557990 doi:10.1006/geno.1995.1040
Rincon J.C., Engler S.K., Hargrove B.W., Kunkel G.R. (1998). Molecular cloning of a cDNA encoding human SPH-binding factor, a conserved protein that binds to the enhancer-like region of the U6 small nuclear RNA gene promoter. Nucleic Acids Res. 26: 4846—4852. PMID 9776743 doi:10.1093/nar/26.21.4846

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12928 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P52747 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12928 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P52747 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]